Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCCD1P59942 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCCD1P59942 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCCD1P59942 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCCD1P59942 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCCD1P59942 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCCD1P59942 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MCCD1P59942 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCCD1P59942 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCCD1P59942 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCCD1P59942 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCCD1P59942 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCCD1P59942 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCCD1P59942 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MCCD1P59942 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MCCD1P59942 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MCCD1P59942 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MCCD1P59942 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MCCD1P59942 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MCCD1P59942 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MCCD1P59942 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCCD1P59942 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCCD1P59942 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCCD1P59942 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCCD1P59942 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCCD1P59942 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCCD1P59942 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MCCD1P59942 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCCD1P59942 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCCD1P59942 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCCD1P59942 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCCD1P59942 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCCD1P59942 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCCD1P59942 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MCCD1P59942 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCCD1P59942 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCCD1P59942 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCCD1P59942 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCCD1P59942 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCCD1P59942 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MCCD1P59942 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MCCD1P59942 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCCD1P59942 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCCD1P59942 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCCD1P59942 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCCD1P59942 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCCD1P59942 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCCD1P59942 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCCD1P59942 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCCD1P59942 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCCD1P59942 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCCD1P59942 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MCCD1P59942 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCCD1P59942 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCCD1P59942 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCCD1P59942 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCCD1P59942 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCCD1P59942 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCCD1P59942 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCCD1P59942 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MCCD1P59942 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCCD1P59942 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCCD1P59942 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCCD1P59942 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCCD1P59942 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCCD1P59942 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCCD1P59942 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCCD1P59942 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCCD1P59942 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCCD1P59942 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MCCD1P59942 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCCD1P59942 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCCD1P59942 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCCD1P59942 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCCD1P59942 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCCD1P59942 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCCD1P59942 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCCD1P59942 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCCD1P59942 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCCD1P59942 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCCD1P59942 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCCD1P59942 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCCD1P59942 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCCD1P59942 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCCD1P59942 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCCD1P59942 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCCD1P59942 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCCD1P59942 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MCCD1P59942 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCCD1P59942 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCCD1P59942 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCCD1P59942 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCCD1P59942 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCCD1P59942 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCCD1P59942 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCCD1P59942 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCCD1P59942 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCCD1P59942 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCCD1P59942 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCCD1P59942 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms