Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSRP3P50461 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSRP3P50461 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSRP3P50461 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSRP3P50461 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSRP3P50461 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSRP3P50461 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSRP3P50461 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSRP3P50461 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSRP3P50461 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSRP3P50461 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSRP3P50461 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSRP3P50461 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSRP3P50461 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSRP3P50461 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CSRP3P50461 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSRP3P50461 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSRP3P50461 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSRP3P50461 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSRP3P50461 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSRP3P50461 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSRP3P50461 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSRP3P50461 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSRP3P50461 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSRP3P50461 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSRP3P50461 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSRP3P50461 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSRP3P50461 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSRP3P50461 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSRP3P50461 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSRP3P50461 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSRP3P50461 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CSRP3P50461 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSRP3P50461 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSRP3P50461 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSRP3P50461 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSRP3P50461 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSRP3P50461 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSRP3P50461 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSRP3P50461 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSRP3P50461 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSRP3P50461 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSRP3P50461 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSRP3P50461 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSRP3P50461 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CSRP3P50461 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CSRP3P50461 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CSRP3P50461 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSRP3P50461 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSRP3P50461 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSRP3P50461 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSRP3P50461 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CSRP3P50461 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSRP3P50461 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSRP3P50461 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSRP3P50461 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSRP3P50461 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSRP3P50461 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSRP3P50461 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CSRP3P50461 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSRP3P50461 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSRP3P50461 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSRP3P50461 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSRP3P50461 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSRP3P50461 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSRP3P50461 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSRP3P50461 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSRP3P50461 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSRP3P50461 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSRP3P50461 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSRP3P50461 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSRP3P50461 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSRP3P50461 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSRP3P50461 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSRP3P50461 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSRP3P50461 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSRP3P50461 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CSRP3P50461 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSRP3P50461 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSRP3P50461 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSRP3P50461 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSRP3P50461 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSRP3P50461 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSRP3P50461 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSRP3P50461 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSRP3P50461 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSRP3P50461 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSRP3P50461 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSRP3P50461 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSRP3P50461 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSRP3P50461 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSRP3P50461 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSRP3P50461 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSRP3P50461 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSRP3P50461 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSRP3P50461 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSRP3P50461 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSRP3P50461 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSRP3P50461 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSRP3P50461 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms