Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
NESP48681 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
NESP48681 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
NESP48681 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
NESP48681 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC40.99■■■■■ 4.15
NESP48681 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
NESP48681 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
NESP48681 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC40.98■■■■■ 4.15
NESP48681 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
NESP48681 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
NESP48681 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
NESP48681 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.97■■■■■ 4.15
NESP48681 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC40.97■■■■■ 4.15
NESP48681 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
NESP48681 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
NESP48681 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.97■■■■■ 4.15
NESP48681 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
NESP48681 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.97■■■■■ 4.15
NESP48681 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
NESP48681 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
NESP48681 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC40.96■■■■■ 4.15
NESP48681 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
NESP48681 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC40.96■■■■■ 4.15
NESP48681 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC40.96■■■■■ 4.15
NESP48681 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC40.95■■■■■ 4.15
NESP48681 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
NESP48681 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC40.95■■■■■ 4.15
NESP48681 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
NESP48681 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
NESP48681 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC40.94■■■■■ 4.14
NESP48681 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC40.93■■■■■ 4.14
NESP48681 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC40.93■■■■■ 4.14
NESP48681 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
NESP48681 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
NESP48681 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC40.93■■■■■ 4.14
NESP48681 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC40.93■■■■■ 4.14
NESP48681 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.93■■■■■ 4.14
NESP48681 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
NESP48681 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
NESP48681 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
NESP48681 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.92■■■■■ 4.14
NESP48681 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC40.92■■■■■ 4.14
NESP48681 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC40.92■■■■■ 4.14
NESP48681 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC40.92■■■■■ 4.14
NESP48681 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
NESP48681 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.92■■■■■ 4.14
NESP48681 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.91■■■■■ 4.14
NESP48681 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
NESP48681 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
NESP48681 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
NESP48681 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
NESP48681 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC40.91■■■■■ 4.14
NESP48681 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC40.9■■■■■ 4.14
NESP48681 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC40.89■■■■■ 4.14
NESP48681 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC40.89■■■■■ 4.14
NESP48681 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC40.89■■■■■ 4.14
NESP48681 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.89■■■■■ 4.14
NESP48681 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC40.89■■■■■ 4.14
NESP48681 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
NESP48681 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.88■■■■■ 4.13
NESP48681 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC40.88■■■■■ 4.13
NESP48681 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
NESP48681 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC40.87■■■■■ 4.13
NESP48681 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
NESP48681 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
NESP48681 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC40.85■■■■■ 4.13
NESP48681 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC40.85■■■■■ 4.13
NESP48681 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC40.85■■■■■ 4.13
NESP48681 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC40.85■■■■■ 4.13
NESP48681 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
NESP48681 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC40.85■■■■■ 4.13
NESP48681 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC40.85■■■■■ 4.13
NESP48681 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
NESP48681 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
NESP48681 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC40.84■■■■■ 4.13
NESP48681 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
NESP48681 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
NESP48681 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
NESP48681 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
NESP48681 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC40.83■■■■■ 4.13
NESP48681 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
NESP48681 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC40.82■■■■■ 4.13
NESP48681 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.82■■■■■ 4.13
NESP48681 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
NESP48681 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
NESP48681 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC40.82■■■■■ 4.12
NESP48681 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
NESP48681 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
NESP48681 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
NESP48681 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC40.81■■■■■ 4.12
NESP48681 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
NESP48681 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC40.8■■■■■ 4.12
NESP48681 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC40.8■■■■■ 4.12
NESP48681 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
NESP48681 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC40.8■■■■■ 4.12
NESP48681 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC40.79■■■■■ 4.12
NESP48681 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
NESP48681 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC40.79■■■■■ 4.12
NESP48681 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC40.78■■■■■ 4.12
NESP48681 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms