Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
RANGAP1P46060 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
RANGAP1P46060 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
RANGAP1P46060 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
RANGAP1P46060 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
RANGAP1P46060 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
RANGAP1P46060 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
RANGAP1P46060 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
RANGAP1P46060 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC37.55■■■■□ 3.6
RANGAP1P46060 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
RANGAP1P46060 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
RANGAP1P46060 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
RANGAP1P46060 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
RANGAP1P46060 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
RANGAP1P46060 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
RANGAP1P46060 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
RANGAP1P46060 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
RANGAP1P46060 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
RANGAP1P46060 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
RANGAP1P46060 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
RANGAP1P46060 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
RANGAP1P46060 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
RANGAP1P46060 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
RANGAP1P46060 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
RANGAP1P46060 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
RANGAP1P46060 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
RANGAP1P46060 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
RANGAP1P46060 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
RANGAP1P46060 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
RANGAP1P46060 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
RANGAP1P46060 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
RANGAP1P46060 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
RANGAP1P46060 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
RANGAP1P46060 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
RANGAP1P46060 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
RANGAP1P46060 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
RANGAP1P46060 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
RANGAP1P46060 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
RANGAP1P46060 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
RANGAP1P46060 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
RANGAP1P46060 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
RANGAP1P46060 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
RANGAP1P46060 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
RANGAP1P46060 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
RANGAP1P46060 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
RANGAP1P46060 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
RANGAP1P46060 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
RANGAP1P46060 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
RANGAP1P46060 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
RANGAP1P46060 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
RANGAP1P46060 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
RANGAP1P46060 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
RANGAP1P46060 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
RANGAP1P46060 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
RANGAP1P46060 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
RANGAP1P46060 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
RANGAP1P46060 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
RANGAP1P46060 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
RANGAP1P46060 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
RANGAP1P46060 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
RANGAP1P46060 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC37.43■■■■□ 3.58
RANGAP1P46060 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
RANGAP1P46060 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
RANGAP1P46060 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
RANGAP1P46060 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
RANGAP1P46060 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
RANGAP1P46060 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
RANGAP1P46060 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
RANGAP1P46060 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
RANGAP1P46060 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
RANGAP1P46060 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
RANGAP1P46060 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
RANGAP1P46060 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
RANGAP1P46060 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
RANGAP1P46060 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
RANGAP1P46060 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
RANGAP1P46060 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
RANGAP1P46060 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
RANGAP1P46060 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
RANGAP1P46060 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
RANGAP1P46060 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
RANGAP1P46060 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
RANGAP1P46060 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
RANGAP1P46060 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
RANGAP1P46060 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
RANGAP1P46060 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
RANGAP1P46060 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
RANGAP1P46060 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
RANGAP1P46060 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
RANGAP1P46060 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
RANGAP1P46060 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC37.37■■■■□ 3.57
RANGAP1P46060 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
RANGAP1P46060 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
RANGAP1P46060 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
RANGAP1P46060 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
RANGAP1P46060 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
RANGAP1P46060 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
RANGAP1P46060 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
RANGAP1P46060 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
RANGAP1P46060 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms