Protein–RNA interactions for Protein: P41597

CCR2, C-C chemokine receptor type 2, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR2P41597 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCR2P41597 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCR2P41597 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCR2P41597 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCR2P41597 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCR2P41597 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCR2P41597 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCR2P41597 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCR2P41597 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCR2P41597 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCR2P41597 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCR2P41597 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCR2P41597 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCR2P41597 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCR2P41597 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCR2P41597 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCR2P41597 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCR2P41597 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCR2P41597 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCR2P41597 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCR2P41597 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCR2P41597 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCR2P41597 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCR2P41597 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCR2P41597 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCR2P41597 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCR2P41597 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCR2P41597 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCR2P41597 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCR2P41597 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCR2P41597 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCR2P41597 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCR2P41597 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCR2P41597 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCR2P41597 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCR2P41597 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCR2P41597 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCR2P41597 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCR2P41597 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCR2P41597 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCR2P41597 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCR2P41597 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCR2P41597 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCR2P41597 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCR2P41597 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCR2P41597 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCR2P41597 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCR2P41597 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCR2P41597 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCR2P41597 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCR2P41597 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCR2P41597 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCR2P41597 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCR2P41597 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCR2P41597 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCR2P41597 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCR2P41597 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCR2P41597 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCR2P41597 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCR2P41597 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCR2P41597 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCR2P41597 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCR2P41597 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCR2P41597 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCR2P41597 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCR2P41597 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCR2P41597 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCR2P41597 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCR2P41597 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCR2P41597 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCR2P41597 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCR2P41597 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCR2P41597 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCR2P41597 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCR2P41597 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCR2P41597 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCR2P41597 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCR2P41597 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCR2P41597 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCR2P41597 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCR2P41597 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCR2P41597 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCR2P41597 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCR2P41597 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCR2P41597 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCR2P41597 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCR2P41597 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCR2P41597 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCR2P41597 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCR2P41597 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCR2P41597 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCR2P41597 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCR2P41597 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCR2P41597 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCR2P41597 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCR2P41597 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCR2P41597 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCR2P41597 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCR2P41597 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCR2P41597 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms