Protein–RNA interactions for Protein: P19623

SRM, Spermidine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRMP19623 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRMP19623 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRMP19623 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRMP19623 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRMP19623 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRMP19623 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRMP19623 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRMP19623 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRMP19623 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRMP19623 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRMP19623 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRMP19623 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRMP19623 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRMP19623 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRMP19623 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRMP19623 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRMP19623 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRMP19623 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRMP19623 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRMP19623 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRMP19623 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRMP19623 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRMP19623 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRMP19623 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRMP19623 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRMP19623 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRMP19623 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRMP19623 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRMP19623 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRMP19623 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRMP19623 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRMP19623 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRMP19623 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRMP19623 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRMP19623 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRMP19623 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SRMP19623 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SRMP19623 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRMP19623 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRMP19623 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRMP19623 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRMP19623 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRMP19623 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRMP19623 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRMP19623 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRMP19623 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRMP19623 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRMP19623 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SRMP19623 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRMP19623 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRMP19623 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRMP19623 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRMP19623 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRMP19623 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRMP19623 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRMP19623 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRMP19623 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRMP19623 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRMP19623 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRMP19623 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRMP19623 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRMP19623 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRMP19623 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRMP19623 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRMP19623 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRMP19623 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRMP19623 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRMP19623 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRMP19623 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRMP19623 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SRMP19623 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRMP19623 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRMP19623 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRMP19623 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRMP19623 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRMP19623 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRMP19623 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRMP19623 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRMP19623 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRMP19623 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRMP19623 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRMP19623 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRMP19623 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRMP19623 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SRMP19623 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRMP19623 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRMP19623 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SRMP19623 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRMP19623 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRMP19623 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRMP19623 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRMP19623 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRMP19623 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRMP19623 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRMP19623 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRMP19623 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRMP19623 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRMP19623 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRMP19623 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRMP19623 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms