Protein–RNA interactions for Protein: P17096

HMGA1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGA1P17096 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HMGA1P17096 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMGA1P17096 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMGA1P17096 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMGA1P17096 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMGA1P17096 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMGA1P17096 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMGA1P17096 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGA1P17096 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGA1P17096 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGA1P17096 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGA1P17096 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGA1P17096 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGA1P17096 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGA1P17096 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGA1P17096 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMGA1P17096 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMGA1P17096 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMGA1P17096 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMGA1P17096 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HMGA1P17096 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMGA1P17096 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HMGA1P17096 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMGA1P17096 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMGA1P17096 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMGA1P17096 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMGA1P17096 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMGA1P17096 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HMGA1P17096 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMGA1P17096 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMGA1P17096 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HMGA1P17096 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMGA1P17096 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
HMGA1P17096 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGA1P17096 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGA1P17096 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGA1P17096 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGA1P17096 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGA1P17096 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGA1P17096 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGA1P17096 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGA1P17096 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMGA1P17096 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMGA1P17096 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMGA1P17096 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMGA1P17096 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMGA1P17096 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMGA1P17096 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMGA1P17096 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMGA1P17096 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMGA1P17096 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMGA1P17096 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMGA1P17096 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMGA1P17096 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMGA1P17096 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMGA1P17096 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMGA1P17096 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMGA1P17096 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMGA1P17096 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMGA1P17096 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMGA1P17096 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMGA1P17096 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMGA1P17096 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMGA1P17096 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMGA1P17096 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMGA1P17096 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMGA1P17096 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMGA1P17096 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMGA1P17096 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGA1P17096 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGA1P17096 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGA1P17096 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGA1P17096 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGA1P17096 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGA1P17096 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGA1P17096 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGA1P17096 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMGA1P17096 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMGA1P17096 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMGA1P17096 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMGA1P17096 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMGA1P17096 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMGA1P17096 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMGA1P17096 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMGA1P17096 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGA1P17096 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGA1P17096 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGA1P17096 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGA1P17096 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGA1P17096 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGA1P17096 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGA1P17096 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGA1P17096 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGA1P17096 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGA1P17096 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGA1P17096 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGA1P17096 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMGA1P17096 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMGA1P17096 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMGA1P17096 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms