Protein–RNA interactions for Protein: P17029

ZKSCAN1, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN1P17029 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZKSCAN1P17029 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZKSCAN1P17029 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZKSCAN1P17029 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZKSCAN1P17029 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZKSCAN1P17029 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZKSCAN1P17029 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZKSCAN1P17029 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZKSCAN1P17029 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZKSCAN1P17029 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZKSCAN1P17029 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZKSCAN1P17029 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZKSCAN1P17029 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZKSCAN1P17029 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZKSCAN1P17029 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZKSCAN1P17029 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZKSCAN1P17029 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZKSCAN1P17029 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZKSCAN1P17029 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ZKSCAN1P17029 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZKSCAN1P17029 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZKSCAN1P17029 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZKSCAN1P17029 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZKSCAN1P17029 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZKSCAN1P17029 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZKSCAN1P17029 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
ZKSCAN1P17029 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZKSCAN1P17029 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZKSCAN1P17029 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZKSCAN1P17029 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZKSCAN1P17029 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZKSCAN1P17029 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZKSCAN1P17029 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZKSCAN1P17029 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZKSCAN1P17029 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZKSCAN1P17029 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZKSCAN1P17029 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZKSCAN1P17029 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZKSCAN1P17029 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZKSCAN1P17029 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZKSCAN1P17029 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZKSCAN1P17029 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZKSCAN1P17029 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZKSCAN1P17029 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZKSCAN1P17029 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZKSCAN1P17029 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZKSCAN1P17029 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZKSCAN1P17029 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZKSCAN1P17029 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZKSCAN1P17029 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZKSCAN1P17029 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZKSCAN1P17029 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZKSCAN1P17029 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZKSCAN1P17029 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZKSCAN1P17029 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZKSCAN1P17029 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZKSCAN1P17029 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZKSCAN1P17029 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZKSCAN1P17029 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZKSCAN1P17029 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZKSCAN1P17029 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZKSCAN1P17029 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZKSCAN1P17029 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ZKSCAN1P17029 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZKSCAN1P17029 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZKSCAN1P17029 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZKSCAN1P17029 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZKSCAN1P17029 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZKSCAN1P17029 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZKSCAN1P17029 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZKSCAN1P17029 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZKSCAN1P17029 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZKSCAN1P17029 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZKSCAN1P17029 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ZKSCAN1P17029 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ZKSCAN1P17029 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZKSCAN1P17029 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZKSCAN1P17029 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZKSCAN1P17029 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZKSCAN1P17029 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZKSCAN1P17029 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZKSCAN1P17029 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZKSCAN1P17029 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZKSCAN1P17029 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZKSCAN1P17029 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZKSCAN1P17029 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZKSCAN1P17029 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZKSCAN1P17029 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZKSCAN1P17029 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ZKSCAN1P17029 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ZKSCAN1P17029 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZKSCAN1P17029 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZKSCAN1P17029 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZKSCAN1P17029 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZKSCAN1P17029 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZKSCAN1P17029 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ZKSCAN1P17029 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZKSCAN1P17029 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZKSCAN1P17029 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZKSCAN1P17029 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.7 ms