Protein–RNA interactions for Protein: P0DP02

IGHV3-30-3, Immunoglobulin heavy variable 3-30-3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-30-3P0DP02 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms