Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB3P05106 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB3P05106 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB3P05106 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB3P05106 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB3P05106 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB3P05106 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGB3P05106 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGB3P05106 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGB3P05106 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGB3P05106 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGB3P05106 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGB3P05106 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGB3P05106 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB3P05106 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB3P05106 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB3P05106 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB3P05106 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB3P05106 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB3P05106 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB3P05106 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGB3P05106 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGB3P05106 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGB3P05106 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGB3P05106 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGB3P05106 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGB3P05106 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGB3P05106 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGB3P05106 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGB3P05106 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGB3P05106 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGB3P05106 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGB3P05106 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGB3P05106 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGB3P05106 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGB3P05106 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGB3P05106 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGB3P05106 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGB3P05106 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGB3P05106 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITGB3P05106 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGB3P05106 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGB3P05106 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGB3P05106 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGB3P05106 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGB3P05106 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGB3P05106 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGB3P05106 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGB3P05106 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGB3P05106 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGB3P05106 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGB3P05106 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGB3P05106 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGB3P05106 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGB3P05106 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGB3P05106 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGB3P05106 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGB3P05106 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGB3P05106 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGB3P05106 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGB3P05106 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGB3P05106 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGB3P05106 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGB3P05106 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGB3P05106 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGB3P05106 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGB3P05106 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGB3P05106 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGB3P05106 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGB3P05106 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGB3P05106 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGB3P05106 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGB3P05106 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGB3P05106 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGB3P05106 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGB3P05106 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGB3P05106 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGB3P05106 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGB3P05106 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGB3P05106 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGB3P05106 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGB3P05106 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGB3P05106 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGB3P05106 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGB3P05106 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGB3P05106 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGB3P05106 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB3P05106 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB3P05106 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB3P05106 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB3P05106 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGB3P05106 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGB3P05106 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGB3P05106 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGB3P05106 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB3P05106 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB3P05106 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB3P05106 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB3P05106 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB3P05106 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms