Protein–RNA interactions for Protein: P02771

AFP, Alpha-fetoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFPP02771 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AFPP02771 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AFPP02771 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AFPP02771 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
AFPP02771 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
AFPP02771 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AFPP02771 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AFPP02771 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AFPP02771 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AFPP02771 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AFPP02771 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AFPP02771 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AFPP02771 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AFPP02771 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AFPP02771 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AFPP02771 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AFPP02771 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AFPP02771 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AFPP02771 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AFPP02771 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AFPP02771 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AFPP02771 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AFPP02771 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AFPP02771 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AFPP02771 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AFPP02771 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
AFPP02771 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AFPP02771 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AFPP02771 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AFPP02771 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AFPP02771 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AFPP02771 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AFPP02771 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AFPP02771 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AFPP02771 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AFPP02771 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AFPP02771 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AFPP02771 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AFPP02771 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AFPP02771 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AFPP02771 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AFPP02771 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AFPP02771 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AFPP02771 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AFPP02771 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AFPP02771 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AFPP02771 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AFPP02771 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AFPP02771 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
AFPP02771 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AFPP02771 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AFPP02771 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
AFPP02771 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AFPP02771 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AFPP02771 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AFPP02771 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AFPP02771 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AFPP02771 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AFPP02771 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AFPP02771 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AFPP02771 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AFPP02771 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AFPP02771 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AFPP02771 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AFPP02771 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
AFPP02771 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AFPP02771 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AFPP02771 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AFPP02771 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
AFPP02771 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
AFPP02771 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AFPP02771 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AFPP02771 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AFPP02771 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AFPP02771 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AFPP02771 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AFPP02771 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AFPP02771 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AFPP02771 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AFPP02771 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
AFPP02771 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
AFPP02771 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
AFPP02771 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
AFPP02771 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
AFPP02771 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
AFPP02771 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
AFPP02771 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AFPP02771 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
AFPP02771 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
AFPP02771 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AFPP02771 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
AFPP02771 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AFPP02771 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
AFPP02771 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AFPP02771 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AFPP02771 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AFPP02771 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AFPP02771 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AFPP02771 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AFPP02771 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms