Protein–RNA interactions for Protein: P02585

TNNC2, Troponin C, skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC2P02585 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNC2P02585 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNC2P02585 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNC2P02585 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNC2P02585 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNC2P02585 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNC2P02585 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNC2P02585 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNC2P02585 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNC2P02585 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNC2P02585 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNC2P02585 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNC2P02585 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNC2P02585 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TNNC2P02585 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TNNC2P02585 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TNNC2P02585 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNC2P02585 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNC2P02585 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNC2P02585 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNC2P02585 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNC2P02585 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNC2P02585 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNC2P02585 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNC2P02585 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNC2P02585 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNC2P02585 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNC2P02585 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNC2P02585 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNC2P02585 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNC2P02585 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNC2P02585 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNC2P02585 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNC2P02585 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNC2P02585 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNC2P02585 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNC2P02585 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNC2P02585 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNC2P02585 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNC2P02585 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNC2P02585 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNC2P02585 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNC2P02585 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNC2P02585 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNC2P02585 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNC2P02585 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNC2P02585 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNC2P02585 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNC2P02585 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNC2P02585 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNC2P02585 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNC2P02585 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNC2P02585 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNC2P02585 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNC2P02585 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNC2P02585 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNC2P02585 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNC2P02585 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNC2P02585 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNC2P02585 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNC2P02585 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNC2P02585 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNC2P02585 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNC2P02585 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNNC2P02585 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNNC2P02585 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TNNC2P02585 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TNNC2P02585 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNNC2P02585 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TNNC2P02585 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNNC2P02585 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNNC2P02585 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNNC2P02585 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNC2P02585 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNC2P02585 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNC2P02585 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNC2P02585 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNC2P02585 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNC2P02585 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNC2P02585 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNC2P02585 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNC2P02585 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNC2P02585 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNC2P02585 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNC2P02585 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNC2P02585 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNC2P02585 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNC2P02585 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNC2P02585 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNC2P02585 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNC2P02585 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNC2P02585 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNC2P02585 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNC2P02585 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNC2P02585 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNC2P02585 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNC2P02585 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNC2P02585 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNC2P02585 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TNNC2P02585 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms