Protein–RNA interactions for Protein: P02545

LMNA, Prelamin-A/C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNAP02545 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMNAP02545 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LMNAP02545 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMNAP02545 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMNAP02545 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMNAP02545 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMNAP02545 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMNAP02545 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMNAP02545 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMNAP02545 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMNAP02545 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMNAP02545 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMNAP02545 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMNAP02545 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMNAP02545 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMNAP02545 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMNAP02545 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LMNAP02545 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMNAP02545 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMNAP02545 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMNAP02545 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LMNAP02545 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMNAP02545 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMNAP02545 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMNAP02545 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMNAP02545 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMNAP02545 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMNAP02545 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMNAP02545 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMNAP02545 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMNAP02545 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LMNAP02545 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMNAP02545 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMNAP02545 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMNAP02545 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMNAP02545 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMNAP02545 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMNAP02545 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMNAP02545 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMNAP02545 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LMNAP02545 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMNAP02545 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMNAP02545 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMNAP02545 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMNAP02545 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMNAP02545 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMNAP02545 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMNAP02545 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMNAP02545 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMNAP02545 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMNAP02545 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMNAP02545 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMNAP02545 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMNAP02545 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMNAP02545 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMNAP02545 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMNAP02545 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LMNAP02545 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMNAP02545 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMNAP02545 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LMNAP02545 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LMNAP02545 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LMNAP02545 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LMNAP02545 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LMNAP02545 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMNAP02545 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMNAP02545 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMNAP02545 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMNAP02545 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMNAP02545 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMNAP02545 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMNAP02545 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LMNAP02545 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMNAP02545 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMNAP02545 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMNAP02545 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMNAP02545 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LMNAP02545 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMNAP02545 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMNAP02545 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMNAP02545 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMNAP02545 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMNAP02545 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMNAP02545 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMNAP02545 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMNAP02545 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMNAP02545 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMNAP02545 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMNAP02545 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
LMNAP02545 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LMNAP02545 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMNAP02545 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMNAP02545 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMNAP02545 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMNAP02545 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMNAP02545 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LMNAP02545 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMNAP02545 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMNAP02545 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LMNAP02545 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms