Protein–RNA interactions for Protein: O95343

SIX3, Homeobox protein SIX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3O95343 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIX3O95343 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIX3O95343 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIX3O95343 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIX3O95343 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIX3O95343 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIX3O95343 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIX3O95343 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIX3O95343 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SIX3O95343 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIX3O95343 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIX3O95343 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIX3O95343 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIX3O95343 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIX3O95343 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIX3O95343 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIX3O95343 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIX3O95343 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIX3O95343 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIX3O95343 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIX3O95343 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIX3O95343 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIX3O95343 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIX3O95343 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIX3O95343 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIX3O95343 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIX3O95343 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIX3O95343 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIX3O95343 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIX3O95343 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIX3O95343 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIX3O95343 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIX3O95343 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIX3O95343 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIX3O95343 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIX3O95343 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIX3O95343 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIX3O95343 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIX3O95343 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIX3O95343 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIX3O95343 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SIX3O95343 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SIX3O95343 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIX3O95343 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIX3O95343 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIX3O95343 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SIX3O95343 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SIX3O95343 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SIX3O95343 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SIX3O95343 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIX3O95343 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIX3O95343 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIX3O95343 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIX3O95343 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIX3O95343 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIX3O95343 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIX3O95343 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIX3O95343 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIX3O95343 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIX3O95343 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIX3O95343 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIX3O95343 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIX3O95343 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SIX3O95343 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIX3O95343 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIX3O95343 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIX3O95343 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIX3O95343 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIX3O95343 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIX3O95343 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIX3O95343 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIX3O95343 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIX3O95343 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIX3O95343 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIX3O95343 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIX3O95343 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIX3O95343 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIX3O95343 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIX3O95343 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIX3O95343 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIX3O95343 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIX3O95343 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIX3O95343 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIX3O95343 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIX3O95343 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIX3O95343 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIX3O95343 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIX3O95343 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIX3O95343 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIX3O95343 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIX3O95343 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIX3O95343 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIX3O95343 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIX3O95343 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIX3O95343 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SIX3O95343 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIX3O95343 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIX3O95343 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIX3O95343 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIX3O95343 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms