Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSO75390 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSO75390 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSO75390 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSO75390 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSO75390 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CSO75390 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSO75390 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSO75390 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSO75390 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSO75390 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSO75390 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSO75390 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSO75390 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSO75390 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSO75390 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSO75390 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSO75390 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSO75390 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSO75390 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSO75390 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSO75390 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSO75390 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSO75390 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSO75390 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSO75390 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSO75390 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSO75390 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSO75390 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSO75390 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CSO75390 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSO75390 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSO75390 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSO75390 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSO75390 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSO75390 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSO75390 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CSO75390 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSO75390 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSO75390 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSO75390 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSO75390 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSO75390 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSO75390 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CSO75390 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CSO75390 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CSO75390 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSO75390 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSO75390 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CSO75390 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSO75390 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSO75390 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSO75390 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSO75390 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSO75390 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSO75390 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSO75390 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSO75390 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSO75390 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSO75390 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSO75390 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSO75390 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSO75390 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSO75390 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSO75390 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSO75390 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CSO75390 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CSO75390 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSO75390 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSO75390 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSO75390 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CSO75390 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSO75390 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSO75390 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CSO75390 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSO75390 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSO75390 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSO75390 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSO75390 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSO75390 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSO75390 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSO75390 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CSO75390 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSO75390 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSO75390 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSO75390 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSO75390 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSO75390 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSO75390 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSO75390 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSO75390 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSO75390 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CSO75390 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CSO75390 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSO75390 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CSO75390 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSO75390 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSO75390 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSO75390 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSO75390 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms