Protein–RNA interactions for Protein: O60664

PLIN3, Perilipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN3O60664 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLIN3O60664 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLIN3O60664 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLIN3O60664 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLIN3O60664 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PLIN3O60664 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLIN3O60664 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PLIN3O60664 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLIN3O60664 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLIN3O60664 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLIN3O60664 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLIN3O60664 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PLIN3O60664 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLIN3O60664 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLIN3O60664 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLIN3O60664 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLIN3O60664 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLIN3O60664 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLIN3O60664 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PLIN3O60664 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLIN3O60664 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLIN3O60664 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLIN3O60664 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLIN3O60664 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLIN3O60664 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLIN3O60664 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLIN3O60664 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLIN3O60664 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLIN3O60664 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLIN3O60664 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLIN3O60664 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLIN3O60664 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLIN3O60664 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLIN3O60664 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLIN3O60664 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLIN3O60664 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLIN3O60664 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLIN3O60664 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLIN3O60664 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLIN3O60664 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLIN3O60664 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLIN3O60664 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLIN3O60664 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLIN3O60664 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLIN3O60664 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLIN3O60664 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLIN3O60664 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLIN3O60664 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLIN3O60664 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PLIN3O60664 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PLIN3O60664 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PLIN3O60664 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PLIN3O60664 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLIN3O60664 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLIN3O60664 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLIN3O60664 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLIN3O60664 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLIN3O60664 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLIN3O60664 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLIN3O60664 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLIN3O60664 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PLIN3O60664 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLIN3O60664 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLIN3O60664 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLIN3O60664 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLIN3O60664 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLIN3O60664 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLIN3O60664 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLIN3O60664 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLIN3O60664 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLIN3O60664 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLIN3O60664 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLIN3O60664 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLIN3O60664 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLIN3O60664 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLIN3O60664 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLIN3O60664 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLIN3O60664 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLIN3O60664 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLIN3O60664 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLIN3O60664 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLIN3O60664 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLIN3O60664 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLIN3O60664 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLIN3O60664 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLIN3O60664 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLIN3O60664 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLIN3O60664 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLIN3O60664 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLIN3O60664 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLIN3O60664 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLIN3O60664 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLIN3O60664 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLIN3O60664 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLIN3O60664 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLIN3O60664 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLIN3O60664 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLIN3O60664 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLIN3O60664 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLIN3O60664 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.8 ms