Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PPLO60437 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PPLO60437 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PPLO60437 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PPLO60437 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PPLO60437 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PPLO60437 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PPLO60437 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PPLO60437 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PPLO60437 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
PPLO60437 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PPLO60437 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PPLO60437 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PPLO60437 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PPLO60437 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PPLO60437 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PPLO60437 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PPLO60437 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PPLO60437 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
PPLO60437 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
PPLO60437 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PPLO60437 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PPLO60437 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PPLO60437 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PPLO60437 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PPLO60437 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PPLO60437 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PPLO60437 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PPLO60437 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PPLO60437 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.93
PPLO60437 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PPLO60437 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
PPLO60437 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
PPLO60437 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PPLO60437 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PPLO60437 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PPLO60437 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PPLO60437 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PPLO60437 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PPLO60437 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
PPLO60437 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PPLO60437 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PPLO60437 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PPLO60437 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
PPLO60437 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PPLO60437 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PPLO60437 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PPLO60437 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
PPLO60437 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PPLO60437 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PPLO60437 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PPLO60437 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
PPLO60437 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
PPLO60437 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
PPLO60437 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PPLO60437 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PPLO60437 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PPLO60437 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PPLO60437 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PPLO60437 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PPLO60437 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PPLO60437 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PPLO60437 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PPLO60437 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PPLO60437 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PPLO60437 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PPLO60437 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PPLO60437 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PPLO60437 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PPLO60437 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PPLO60437 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PPLO60437 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PPLO60437 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
PPLO60437 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PPLO60437 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PPLO60437 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PPLO60437 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PPLO60437 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PPLO60437 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PPLO60437 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
PPLO60437 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PPLO60437 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PPLO60437 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PPLO60437 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PPLO60437 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PPLO60437 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PPLO60437 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
PPLO60437 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PPLO60437 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PPLO60437 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PPLO60437 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PPLO60437 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
PPLO60437 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PPLO60437 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PPLO60437 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
PPLO60437 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PPLO60437 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PPLO60437 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PPLO60437 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PPLO60437 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms