Protein–RNA interactions for Protein: O60238

BNIP3L, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3LO60238 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BNIP3LO60238 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BNIP3LO60238 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BNIP3LO60238 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BNIP3LO60238 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BNIP3LO60238 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BNIP3LO60238 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BNIP3LO60238 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BNIP3LO60238 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BNIP3LO60238 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BNIP3LO60238 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BNIP3LO60238 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BNIP3LO60238 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BNIP3LO60238 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BNIP3LO60238 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BNIP3LO60238 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BNIP3LO60238 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BNIP3LO60238 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BNIP3LO60238 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BNIP3LO60238 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BNIP3LO60238 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BNIP3LO60238 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BNIP3LO60238 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BNIP3LO60238 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BNIP3LO60238 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BNIP3LO60238 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BNIP3LO60238 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BNIP3LO60238 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BNIP3LO60238 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
BNIP3LO60238 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BNIP3LO60238 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BNIP3LO60238 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BNIP3LO60238 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BNIP3LO60238 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BNIP3LO60238 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BNIP3LO60238 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BNIP3LO60238 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BNIP3LO60238 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BNIP3LO60238 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BNIP3LO60238 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BNIP3LO60238 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BNIP3LO60238 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BNIP3LO60238 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BNIP3LO60238 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BNIP3LO60238 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BNIP3LO60238 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BNIP3LO60238 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BNIP3LO60238 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BNIP3LO60238 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BNIP3LO60238 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BNIP3LO60238 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BNIP3LO60238 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BNIP3LO60238 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BNIP3LO60238 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BNIP3LO60238 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
BNIP3LO60238 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BNIP3LO60238 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BNIP3LO60238 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BNIP3LO60238 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BNIP3LO60238 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BNIP3LO60238 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BNIP3LO60238 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BNIP3LO60238 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BNIP3LO60238 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BNIP3LO60238 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BNIP3LO60238 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BNIP3LO60238 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BNIP3LO60238 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BNIP3LO60238 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BNIP3LO60238 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BNIP3LO60238 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BNIP3LO60238 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BNIP3LO60238 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BNIP3LO60238 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BNIP3LO60238 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BNIP3LO60238 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BNIP3LO60238 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BNIP3LO60238 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BNIP3LO60238 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BNIP3LO60238 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BNIP3LO60238 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BNIP3LO60238 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BNIP3LO60238 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BNIP3LO60238 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BNIP3LO60238 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BNIP3LO60238 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BNIP3LO60238 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BNIP3LO60238 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BNIP3LO60238 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BNIP3LO60238 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BNIP3LO60238 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BNIP3LO60238 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BNIP3LO60238 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BNIP3LO60238 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BNIP3LO60238 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
BNIP3LO60238 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BNIP3LO60238 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BNIP3LO60238 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
BNIP3LO60238 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BNIP3LO60238 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.1 ms