Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DHX16O60231 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DHX16O60231 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
DHX16O60231 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
DHX16O60231 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
DHX16O60231 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
DHX16O60231 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
DHX16O60231 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
DHX16O60231 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DHX16O60231 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DHX16O60231 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DHX16O60231 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DHX16O60231 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DHX16O60231 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
DHX16O60231 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DHX16O60231 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DHX16O60231 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DHX16O60231 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DHX16O60231 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DHX16O60231 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DHX16O60231 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DHX16O60231 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DHX16O60231 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DHX16O60231 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DHX16O60231 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DHX16O60231 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DHX16O60231 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DHX16O60231 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DHX16O60231 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DHX16O60231 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DHX16O60231 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DHX16O60231 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DHX16O60231 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DHX16O60231 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DHX16O60231 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DHX16O60231 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
DHX16O60231 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DHX16O60231 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DHX16O60231 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DHX16O60231 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DHX16O60231 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DHX16O60231 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DHX16O60231 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DHX16O60231 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DHX16O60231 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DHX16O60231 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DHX16O60231 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DHX16O60231 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DHX16O60231 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DHX16O60231 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DHX16O60231 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DHX16O60231 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DHX16O60231 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DHX16O60231 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DHX16O60231 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DHX16O60231 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DHX16O60231 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DHX16O60231 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DHX16O60231 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DHX16O60231 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DHX16O60231 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DHX16O60231 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DHX16O60231 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DHX16O60231 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DHX16O60231 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DHX16O60231 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DHX16O60231 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DHX16O60231 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DHX16O60231 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DHX16O60231 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
DHX16O60231 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DHX16O60231 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
DHX16O60231 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DHX16O60231 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DHX16O60231 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
DHX16O60231 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DHX16O60231 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DHX16O60231 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DHX16O60231 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
DHX16O60231 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DHX16O60231 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DHX16O60231 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DHX16O60231 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DHX16O60231 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DHX16O60231 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
DHX16O60231 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DHX16O60231 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DHX16O60231 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DHX16O60231 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
DHX16O60231 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
DHX16O60231 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DHX16O60231 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DHX16O60231 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DHX16O60231 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
DHX16O60231 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DHX16O60231 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DHX16O60231 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DHX16O60231 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
DHX16O60231 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DHX16O60231 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms