Protein–RNA interactions for Protein: O43303

CCP110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCP110O43303 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCP110O43303 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCP110O43303 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCP110O43303 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCP110O43303 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCP110O43303 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCP110O43303 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCP110O43303 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCP110O43303 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCP110O43303 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCP110O43303 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCP110O43303 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCP110O43303 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCP110O43303 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCP110O43303 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCP110O43303 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCP110O43303 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCP110O43303 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCP110O43303 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCP110O43303 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCP110O43303 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCP110O43303 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCP110O43303 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCP110O43303 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCP110O43303 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCP110O43303 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCP110O43303 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCP110O43303 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCP110O43303 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCP110O43303 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCP110O43303 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
CCP110O43303 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
CCP110O43303 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCP110O43303 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCP110O43303 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCP110O43303 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCP110O43303 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCP110O43303 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCP110O43303 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCP110O43303 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCP110O43303 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCP110O43303 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCP110O43303 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCP110O43303 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCP110O43303 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCP110O43303 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCP110O43303 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCP110O43303 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCP110O43303 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCP110O43303 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCP110O43303 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCP110O43303 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCP110O43303 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCP110O43303 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCP110O43303 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCP110O43303 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCP110O43303 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCP110O43303 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCP110O43303 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCP110O43303 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCP110O43303 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCP110O43303 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCP110O43303 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCP110O43303 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCP110O43303 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCP110O43303 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCP110O43303 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCP110O43303 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCP110O43303 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCP110O43303 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCP110O43303 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCP110O43303 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCP110O43303 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCP110O43303 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCP110O43303 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CCP110O43303 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCP110O43303 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCP110O43303 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCP110O43303 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCP110O43303 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCP110O43303 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCP110O43303 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCP110O43303 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCP110O43303 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCP110O43303 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCP110O43303 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCP110O43303 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCP110O43303 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCP110O43303 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCP110O43303 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCP110O43303 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCP110O43303 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCP110O43303 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCP110O43303 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCP110O43303 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCP110O43303 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCP110O43303 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCP110O43303 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCP110O43303 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCP110O43303 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms