Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRTM2O43300 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRTM2O43300 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRTM2O43300 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRTM2O43300 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRTM2O43300 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRTM2O43300 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRTM2O43300 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRTM2O43300 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRTM2O43300 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRTM2O43300 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRTM2O43300 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRTM2O43300 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRTM2O43300 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRTM2O43300 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRTM2O43300 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRTM2O43300 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRTM2O43300 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRTM2O43300 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRTM2O43300 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRTM2O43300 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRTM2O43300 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRTM2O43300 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRTM2O43300 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRTM2O43300 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRTM2O43300 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRTM2O43300 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRTM2O43300 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRTM2O43300 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRTM2O43300 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRTM2O43300 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRTM2O43300 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRTM2O43300 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRTM2O43300 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRTM2O43300 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRTM2O43300 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRTM2O43300 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRTM2O43300 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRTM2O43300 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRTM2O43300 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRTM2O43300 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRTM2O43300 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRTM2O43300 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRTM2O43300 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRTM2O43300 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRTM2O43300 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRTM2O43300 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRTM2O43300 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRTM2O43300 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRTM2O43300 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRTM2O43300 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRTM2O43300 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRTM2O43300 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRTM2O43300 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRTM2O43300 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRTM2O43300 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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