Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC7A4O43246 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC7A4O43246 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC7A4O43246 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC7A4O43246 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC7A4O43246 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC7A4O43246 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC7A4O43246 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC7A4O43246 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC7A4O43246 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC7A4O43246 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC7A4O43246 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC7A4O43246 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC7A4O43246 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC7A4O43246 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC7A4O43246 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC7A4O43246 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC7A4O43246 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC7A4O43246 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC7A4O43246 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC7A4O43246 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC7A4O43246 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC7A4O43246 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC7A4O43246 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC7A4O43246 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC7A4O43246 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC7A4O43246 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC7A4O43246 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC7A4O43246 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC7A4O43246 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC7A4O43246 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC7A4O43246 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC7A4O43246 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC7A4O43246 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC7A4O43246 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC7A4O43246 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC7A4O43246 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC7A4O43246 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC7A4O43246 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC7A4O43246 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC7A4O43246 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC7A4O43246 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC7A4O43246 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC7A4O43246 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC7A4O43246 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC7A4O43246 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC7A4O43246 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC7A4O43246 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC7A4O43246 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC7A4O43246 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC7A4O43246 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC7A4O43246 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC7A4O43246 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC7A4O43246 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC7A4O43246 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC7A4O43246 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC7A4O43246 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC7A4O43246 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC7A4O43246 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC7A4O43246 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC7A4O43246 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC7A4O43246 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC7A4O43246 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC7A4O43246 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC7A4O43246 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC7A4O43246 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC7A4O43246 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC7A4O43246 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC7A4O43246 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC7A4O43246 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC7A4O43246 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC7A4O43246 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC7A4O43246 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC7A4O43246 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC7A4O43246 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC7A4O43246 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC7A4O43246 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC7A4O43246 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC7A4O43246 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC7A4O43246 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC7A4O43246 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC7A4O43246 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC7A4O43246 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC7A4O43246 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC7A4O43246 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC7A4O43246 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC7A4O43246 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC7A4O43246 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC7A4O43246 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC7A4O43246 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC7A4O43246 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC7A4O43246 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC7A4O43246 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC7A4O43246 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC7A4O43246 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC7A4O43246 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC7A4O43246 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC7A4O43246 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC7A4O43246 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC7A4O43246 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.1 ms