Protein–RNA interactions for Protein: O14717

TRDMT1, tRNA (cytosine(38)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1O14717 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRDMT1O14717 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRDMT1O14717 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRDMT1O14717 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRDMT1O14717 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRDMT1O14717 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRDMT1O14717 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRDMT1O14717 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRDMT1O14717 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRDMT1O14717 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRDMT1O14717 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRDMT1O14717 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRDMT1O14717 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRDMT1O14717 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRDMT1O14717 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRDMT1O14717 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRDMT1O14717 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRDMT1O14717 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRDMT1O14717 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRDMT1O14717 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRDMT1O14717 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRDMT1O14717 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRDMT1O14717 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRDMT1O14717 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRDMT1O14717 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRDMT1O14717 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRDMT1O14717 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRDMT1O14717 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRDMT1O14717 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRDMT1O14717 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRDMT1O14717 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRDMT1O14717 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRDMT1O14717 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRDMT1O14717 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRDMT1O14717 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRDMT1O14717 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRDMT1O14717 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRDMT1O14717 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRDMT1O14717 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRDMT1O14717 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRDMT1O14717 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRDMT1O14717 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRDMT1O14717 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRDMT1O14717 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRDMT1O14717 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRDMT1O14717 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRDMT1O14717 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRDMT1O14717 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRDMT1O14717 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRDMT1O14717 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRDMT1O14717 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRDMT1O14717 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRDMT1O14717 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRDMT1O14717 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRDMT1O14717 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRDMT1O14717 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRDMT1O14717 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRDMT1O14717 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRDMT1O14717 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRDMT1O14717 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TRDMT1O14717 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRDMT1O14717 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRDMT1O14717 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRDMT1O14717 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRDMT1O14717 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRDMT1O14717 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRDMT1O14717 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRDMT1O14717 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRDMT1O14717 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRDMT1O14717 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRDMT1O14717 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRDMT1O14717 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TRDMT1O14717 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRDMT1O14717 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRDMT1O14717 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRDMT1O14717 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRDMT1O14717 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRDMT1O14717 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRDMT1O14717 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRDMT1O14717 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRDMT1O14717 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRDMT1O14717 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRDMT1O14717 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRDMT1O14717 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRDMT1O14717 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRDMT1O14717 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRDMT1O14717 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRDMT1O14717 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRDMT1O14717 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRDMT1O14717 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRDMT1O14717 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRDMT1O14717 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRDMT1O14717 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRDMT1O14717 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TRDMT1O14717 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRDMT1O14717 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRDMT1O14717 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRDMT1O14717 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TRDMT1O14717 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRDMT1O14717 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.7 ms