Protein–RNA interactions for Protein: O00168

FXYD1, Phospholemman, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXYD1O00168 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FXYD1O00168 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FXYD1O00168 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FXYD1O00168 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FXYD1O00168 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FXYD1O00168 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FXYD1O00168 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FXYD1O00168 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FXYD1O00168 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FXYD1O00168 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FXYD1O00168 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FXYD1O00168 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FXYD1O00168 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FXYD1O00168 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FXYD1O00168 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FXYD1O00168 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FXYD1O00168 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FXYD1O00168 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FXYD1O00168 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FXYD1O00168 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FXYD1O00168 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FXYD1O00168 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FXYD1O00168 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FXYD1O00168 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FXYD1O00168 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FXYD1O00168 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FXYD1O00168 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FXYD1O00168 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FXYD1O00168 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FXYD1O00168 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FXYD1O00168 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FXYD1O00168 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FXYD1O00168 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FXYD1O00168 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FXYD1O00168 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FXYD1O00168 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FXYD1O00168 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FXYD1O00168 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FXYD1O00168 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FXYD1O00168 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FXYD1O00168 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FXYD1O00168 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FXYD1O00168 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FXYD1O00168 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FXYD1O00168 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FXYD1O00168 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FXYD1O00168 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FXYD1O00168 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FXYD1O00168 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FXYD1O00168 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FXYD1O00168 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FXYD1O00168 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FXYD1O00168 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FXYD1O00168 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FXYD1O00168 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FXYD1O00168 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FXYD1O00168 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FXYD1O00168 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FXYD1O00168 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FXYD1O00168 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FXYD1O00168 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FXYD1O00168 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FXYD1O00168 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FXYD1O00168 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FXYD1O00168 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FXYD1O00168 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FXYD1O00168 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FXYD1O00168 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FXYD1O00168 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FXYD1O00168 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FXYD1O00168 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FXYD1O00168 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FXYD1O00168 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FXYD1O00168 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FXYD1O00168 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FXYD1O00168 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FXYD1O00168 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FXYD1O00168 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FXYD1O00168 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
FXYD1O00168 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
FXYD1O00168 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FXYD1O00168 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FXYD1O00168 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FXYD1O00168 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FXYD1O00168 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FXYD1O00168 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FXYD1O00168 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FXYD1O00168 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FXYD1O00168 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FXYD1O00168 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FXYD1O00168 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FXYD1O00168 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FXYD1O00168 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FXYD1O00168 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FXYD1O00168 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FXYD1O00168 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FXYD1O00168 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FXYD1O00168 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FXYD1O00168 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FXYD1O00168 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms