Protein–RNA interactions for Protein: J3QQQ9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QQQ9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3QQQ9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3QQQ9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3QQQ9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3QQQ9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3QQQ9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3QQQ9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3QQQ9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3QQQ9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3QQQ9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3QQQ9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3QQQ9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3QQQ9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3QQQ9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3QQQ9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3QQQ9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
J3QQQ9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3QQQ9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3QQQ9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
J3QQQ9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
J3QQQ9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
J3QQQ9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
J3QQQ9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
J3QQQ9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
J3QQQ9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QQQ9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QQQ9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QQQ9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QQQ9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QQQ9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QQQ9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QQQ9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QQQ9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QQQ9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QQQ9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QQQ9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QQQ9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QQQ9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QQQ9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QQQ9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QQQ9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QQQ9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3QQQ9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3QQQ9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3QQQ9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3QQQ9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3QQQ9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3QQQ9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3QQQ9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3QQQ9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3QQQ9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3QQQ9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3QQQ9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3QQQ9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3QQQ9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3QQQ9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3QQQ9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
J3QQQ9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3QQQ9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3QQQ9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3QQQ9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3QQQ9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3QQQ9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3QQQ9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3QQQ9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3QQQ9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3QQQ9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3QQQ9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3QQQ9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3QQQ9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3QQQ9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3QQQ9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
J3QQQ9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
J3QQQ9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
J3QQQ9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
J3QQQ9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
J3QQQ9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
J3QQQ9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
J3QQQ9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
J3QQQ9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
J3QQQ9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
J3QQQ9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
J3QQQ9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
J3QQQ9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
J3QQQ9 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
J3QQQ9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
J3QQQ9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
J3QQQ9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
J3QQQ9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
J3QQQ9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
J3QQQ9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
J3QQQ9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
J3QQQ9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
J3QQQ9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
J3QQQ9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
J3QQQ9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
J3QQQ9 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
J3QQQ9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
J3QQQ9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
J3QQQ9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms