Protein–RNA interactions for Protein: A6NIL9

CRYM-AS1, Putative uncharacterized protein CRYM-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYM-AS1A6NIL9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CRYM-AS1A6NIL9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CRYM-AS1A6NIL9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CRYM-AS1A6NIL9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CRYM-AS1A6NIL9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRYM-AS1A6NIL9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRYM-AS1A6NIL9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRYM-AS1A6NIL9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRYM-AS1A6NIL9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRYM-AS1A6NIL9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRYM-AS1A6NIL9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRYM-AS1A6NIL9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRYM-AS1A6NIL9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRYM-AS1A6NIL9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRYM-AS1A6NIL9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRYM-AS1A6NIL9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRYM-AS1A6NIL9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRYM-AS1A6NIL9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CRYM-AS1A6NIL9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRYM-AS1A6NIL9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRYM-AS1A6NIL9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRYM-AS1A6NIL9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRYM-AS1A6NIL9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRYM-AS1A6NIL9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRYM-AS1A6NIL9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRYM-AS1A6NIL9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRYM-AS1A6NIL9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRYM-AS1A6NIL9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms