Protein–RNA interactions for Protein: A6NIE6

RRN3P2, Putative RRN3-like protein RRN3P2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P2A6NIE6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RRN3P2A6NIE6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRN3P2A6NIE6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRN3P2A6NIE6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRN3P2A6NIE6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRN3P2A6NIE6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRN3P2A6NIE6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRN3P2A6NIE6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
RRN3P2A6NIE6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRN3P2A6NIE6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRN3P2A6NIE6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRN3P2A6NIE6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RRN3P2A6NIE6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRN3P2A6NIE6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRN3P2A6NIE6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRN3P2A6NIE6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRN3P2A6NIE6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RRN3P2A6NIE6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRN3P2A6NIE6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRN3P2A6NIE6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRN3P2A6NIE6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRN3P2A6NIE6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRN3P2A6NIE6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRN3P2A6NIE6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRN3P2A6NIE6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRN3P2A6NIE6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRN3P2A6NIE6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRN3P2A6NIE6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RRN3P2A6NIE6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRN3P2A6NIE6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRN3P2A6NIE6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRN3P2A6NIE6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRN3P2A6NIE6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRN3P2A6NIE6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRN3P2A6NIE6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRN3P2A6NIE6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRN3P2A6NIE6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRN3P2A6NIE6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRN3P2A6NIE6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRN3P2A6NIE6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RRN3P2A6NIE6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRN3P2A6NIE6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRN3P2A6NIE6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRN3P2A6NIE6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRN3P2A6NIE6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRN3P2A6NIE6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RRN3P2A6NIE6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RRN3P2A6NIE6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RRN3P2A6NIE6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RRN3P2A6NIE6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RRN3P2A6NIE6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RRN3P2A6NIE6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RRN3P2A6NIE6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RRN3P2A6NIE6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RRN3P2A6NIE6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RRN3P2A6NIE6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RRN3P2A6NIE6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RRN3P2A6NIE6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RRN3P2A6NIE6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RRN3P2A6NIE6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRN3P2A6NIE6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRN3P2A6NIE6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRN3P2A6NIE6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRN3P2A6NIE6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRN3P2A6NIE6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRN3P2A6NIE6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRN3P2A6NIE6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRN3P2A6NIE6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRN3P2A6NIE6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRN3P2A6NIE6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRN3P2A6NIE6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRN3P2A6NIE6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRN3P2A6NIE6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRN3P2A6NIE6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRN3P2A6NIE6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRN3P2A6NIE6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRN3P2A6NIE6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRN3P2A6NIE6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRN3P2A6NIE6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRN3P2A6NIE6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRN3P2A6NIE6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RRN3P2A6NIE6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RRN3P2A6NIE6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RRN3P2A6NIE6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RRN3P2A6NIE6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RRN3P2A6NIE6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RRN3P2A6NIE6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RRN3P2A6NIE6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RRN3P2A6NIE6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RRN3P2A6NIE6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RRN3P2A6NIE6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RRN3P2A6NIE6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RRN3P2A6NIE6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RRN3P2A6NIE6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRN3P2A6NIE6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRN3P2A6NIE6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRN3P2A6NIE6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRN3P2A6NIE6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRN3P2A6NIE6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRN3P2A6NIE6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.6 ms