Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC160A6NGH7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC160A6NGH7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC160A6NGH7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC160A6NGH7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC160A6NGH7 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC160A6NGH7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC160A6NGH7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC160A6NGH7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC160A6NGH7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC160A6NGH7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC160A6NGH7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC160A6NGH7 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC160A6NGH7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC160A6NGH7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC160A6NGH7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC160A6NGH7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC160A6NGH7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC160A6NGH7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC160A6NGH7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC160A6NGH7 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC160A6NGH7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC160A6NGH7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC160A6NGH7 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC160A6NGH7 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC160A6NGH7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC160A6NGH7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC160A6NGH7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC160A6NGH7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC160A6NGH7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC160A6NGH7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC160A6NGH7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC160A6NGH7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC160A6NGH7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC160A6NGH7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC160A6NGH7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC160A6NGH7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC160A6NGH7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC160A6NGH7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC160A6NGH7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC160A6NGH7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC160A6NGH7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC160A6NGH7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC160A6NGH7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC160A6NGH7 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC160A6NGH7 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC160A6NGH7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC160A6NGH7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC160A6NGH7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC160A6NGH7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC160A6NGH7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC160A6NGH7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC160A6NGH7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC160A6NGH7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC160A6NGH7 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC160A6NGH7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC160A6NGH7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC160A6NGH7 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC160A6NGH7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC160A6NGH7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC160A6NGH7 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC160A6NGH7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC160A6NGH7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC160A6NGH7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC160A6NGH7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC160A6NGH7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC160A6NGH7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC160A6NGH7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC160A6NGH7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC160A6NGH7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC160A6NGH7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC160A6NGH7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC160A6NGH7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC160A6NGH7 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC160A6NGH7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC160A6NGH7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC160A6NGH7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC160A6NGH7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC160A6NGH7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC160A6NGH7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC160A6NGH7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC160A6NGH7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC160A6NGH7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC160A6NGH7 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC160A6NGH7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC160A6NGH7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC160A6NGH7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC160A6NGH7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC160A6NGH7 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC160A6NGH7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC160A6NGH7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC160A6NGH7 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC160A6NGH7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC160A6NGH7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC160A6NGH7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC160A6NGH7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC160A6NGH7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC160A6NGH7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC160A6NGH7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC160A6NGH7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.8 ms