Protein–RNA interactions for Protein: A6NDK9

GOLGA6C, Golgin subfamily A member 6C, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6CA6NDK9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA6CA6NDK9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA6CA6NDK9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA6CA6NDK9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA6CA6NDK9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA6CA6NDK9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA6CA6NDK9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA6CA6NDK9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA6CA6NDK9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA6CA6NDK9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA6CA6NDK9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA6CA6NDK9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA6CA6NDK9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA6CA6NDK9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA6CA6NDK9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA6CA6NDK9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA6CA6NDK9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA6CA6NDK9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA6CA6NDK9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA6CA6NDK9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA6CA6NDK9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA6CA6NDK9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA6CA6NDK9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA6CA6NDK9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA6CA6NDK9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA6CA6NDK9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA6CA6NDK9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA6CA6NDK9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA6CA6NDK9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA6CA6NDK9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA6CA6NDK9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA6CA6NDK9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA6CA6NDK9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA6CA6NDK9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA6CA6NDK9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA6CA6NDK9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA6CA6NDK9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GOLGA6CA6NDK9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
GOLGA6CA6NDK9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA6CA6NDK9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA6CA6NDK9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA6CA6NDK9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA6CA6NDK9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA6CA6NDK9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA6CA6NDK9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA6CA6NDK9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA6CA6NDK9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA6CA6NDK9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA6CA6NDK9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA6CA6NDK9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA6CA6NDK9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA6CA6NDK9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA6CA6NDK9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA6CA6NDK9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA6CA6NDK9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA6CA6NDK9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA6CA6NDK9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA6CA6NDK9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA6CA6NDK9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA6CA6NDK9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA6CA6NDK9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA6CA6NDK9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA6CA6NDK9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA6CA6NDK9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA6CA6NDK9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA6CA6NDK9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA6CA6NDK9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA6CA6NDK9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA6CA6NDK9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA6CA6NDK9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA6CA6NDK9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA6CA6NDK9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA6CA6NDK9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA6CA6NDK9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA6CA6NDK9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA6CA6NDK9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA6CA6NDK9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA6CA6NDK9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA6CA6NDK9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA6CA6NDK9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA6CA6NDK9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA6CA6NDK9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA6CA6NDK9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA6CA6NDK9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA6CA6NDK9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA6CA6NDK9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA6CA6NDK9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA6CA6NDK9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA6CA6NDK9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA6CA6NDK9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA6CA6NDK9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA6CA6NDK9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA6CA6NDK9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA6CA6NDK9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA6CA6NDK9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA6CA6NDK9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA6CA6NDK9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA6CA6NDK9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA6CA6NDK9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA6CA6NDK9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms