Protein–RNA interactions for Protein: A0A0D9SFI3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0D9SFI3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
A0A0D9SFI3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
A0A0D9SFI3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
A0A0D9SFI3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
A0A0D9SFI3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
A0A0D9SFI3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
A0A0D9SFI3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
A0A0D9SFI3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
A0A0D9SFI3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
A0A0D9SFI3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
A0A0D9SFI3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
A0A0D9SFI3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
A0A0D9SFI3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
A0A0D9SFI3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
A0A0D9SFI3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
A0A0D9SFI3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
A0A0D9SFI3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
A0A0D9SFI3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
A0A0D9SFI3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
A0A0D9SFI3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
A0A0D9SFI3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
A0A0D9SFI3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
A0A0D9SFI3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
A0A0D9SFI3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
A0A0D9SFI3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
A0A0D9SFI3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
A0A0D9SFI3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
A0A0D9SFI3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
A0A0D9SFI3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
A0A0D9SFI3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
A0A0D9SFI3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
A0A0D9SFI3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
A0A0D9SFI3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
A0A0D9SFI3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
A0A0D9SFI3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
A0A0D9SFI3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
A0A0D9SFI3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
A0A0D9SFI3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
A0A0D9SFI3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
A0A0D9SFI3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
A0A0D9SFI3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
A0A0D9SFI3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
A0A0D9SFI3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
A0A0D9SFI3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
A0A0D9SFI3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
A0A0D9SFI3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
A0A0D9SFI3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
A0A0D9SFI3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
A0A0D9SFI3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
A0A0D9SFI3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
A0A0D9SFI3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
A0A0D9SFI3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
A0A0D9SFI3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
A0A0D9SFI3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
A0A0D9SFI3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
A0A0D9SFI3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
A0A0D9SFI3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
A0A0D9SFI3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
A0A0D9SFI3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
A0A0D9SFI3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
A0A0D9SFI3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
A0A0D9SFI3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
A0A0D9SFI3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
A0A0D9SFI3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
A0A0D9SFI3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
A0A0D9SFI3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
A0A0D9SFI3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
A0A0D9SFI3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
A0A0D9SFI3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
A0A0D9SFI3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
A0A0D9SFI3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
A0A0D9SFI3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
A0A0D9SFI3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
A0A0D9SFI3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
A0A0D9SFI3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
A0A0D9SFI3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
A0A0D9SFI3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
A0A0D9SFI3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
A0A0D9SFI3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
A0A0D9SFI3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
A0A0D9SFI3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
A0A0D9SFI3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
A0A0D9SFI3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
A0A0D9SFI3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
A0A0D9SFI3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
A0A0D9SFI3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
A0A0D9SFI3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
A0A0D9SFI3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
A0A0D9SFI3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
A0A0D9SFI3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
A0A0D9SFI3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
A0A0D9SFI3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
A0A0D9SFI3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
A0A0D9SFI3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
A0A0D9SFI3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
A0A0D9SFI3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
A0A0D9SFI3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
A0A0D9SFI3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
A0A0D9SFI3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
A0A0D9SFI3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms