Protein–RNA interactions for Protein: U3KQA8

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQA8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
U3KQA8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
U3KQA8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
U3KQA8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
U3KQA8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
U3KQA8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
U3KQA8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
U3KQA8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
U3KQA8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
U3KQA8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
U3KQA8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
U3KQA8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
U3KQA8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
U3KQA8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
U3KQA8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
U3KQA8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
U3KQA8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
U3KQA8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
U3KQA8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
U3KQA8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
U3KQA8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U3KQA8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
U3KQA8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
U3KQA8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
U3KQA8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
U3KQA8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
U3KQA8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
U3KQA8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
U3KQA8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
U3KQA8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U3KQA8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U3KQA8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
U3KQA8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U3KQA8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
U3KQA8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U3KQA8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
U3KQA8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U3KQA8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U3KQA8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
U3KQA8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U3KQA8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
U3KQA8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
U3KQA8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U3KQA8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U3KQA8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U3KQA8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U3KQA8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U3KQA8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
U3KQA8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
U3KQA8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
U3KQA8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
U3KQA8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
U3KQA8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
U3KQA8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
U3KQA8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
U3KQA8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
U3KQA8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
U3KQA8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
U3KQA8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
U3KQA8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
U3KQA8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
U3KQA8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
U3KQA8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
U3KQA8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
U3KQA8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
U3KQA8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
U3KQA8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
U3KQA8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
U3KQA8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
U3KQA8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
U3KQA8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
U3KQA8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
U3KQA8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
U3KQA8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
U3KQA8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
U3KQA8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
U3KQA8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
U3KQA8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
U3KQA8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
U3KQA8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
U3KQA8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
U3KQA8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
U3KQA8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
U3KQA8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
U3KQA8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
U3KQA8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
U3KQA8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
U3KQA8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
U3KQA8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
U3KQA8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
U3KQA8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
U3KQA8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
U3KQA8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
U3KQA8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
U3KQA8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
U3KQA8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
U3KQA8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
U3KQA8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
U3KQA8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
U3KQA8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms