Protein–RNA interactions for Protein: U3KQ54

PMF1-BGLAP, HCG2044777, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMF1-BGLAPU3KQ54 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PMF1-BGLAPU3KQ54 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PMF1-BGLAPU3KQ54 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PMF1-BGLAPU3KQ54 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PMF1-BGLAPU3KQ54 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PMF1-BGLAPU3KQ54 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PMF1-BGLAPU3KQ54 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PMF1-BGLAPU3KQ54 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PMF1-BGLAPU3KQ54 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PMF1-BGLAPU3KQ54 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PMF1-BGLAPU3KQ54 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PMF1-BGLAPU3KQ54 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PMF1-BGLAPU3KQ54 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PMF1-BGLAPU3KQ54 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PMF1-BGLAPU3KQ54 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PMF1-BGLAPU3KQ54 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PMF1-BGLAPU3KQ54 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PMF1-BGLAPU3KQ54 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PMF1-BGLAPU3KQ54 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PMF1-BGLAPU3KQ54 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PMF1-BGLAPU3KQ54 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PMF1-BGLAPU3KQ54 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PMF1-BGLAPU3KQ54 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PMF1-BGLAPU3KQ54 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PMF1-BGLAPU3KQ54 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PMF1-BGLAPU3KQ54 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PMF1-BGLAPU3KQ54 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PMF1-BGLAPU3KQ54 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PMF1-BGLAPU3KQ54 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PMF1-BGLAPU3KQ54 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PMF1-BGLAPU3KQ54 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PMF1-BGLAPU3KQ54 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PMF1-BGLAPU3KQ54 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PMF1-BGLAPU3KQ54 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PMF1-BGLAPU3KQ54 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PMF1-BGLAPU3KQ54 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PMF1-BGLAPU3KQ54 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PMF1-BGLAPU3KQ54 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PMF1-BGLAPU3KQ54 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PMF1-BGLAPU3KQ54 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PMF1-BGLAPU3KQ54 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PMF1-BGLAPU3KQ54 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PMF1-BGLAPU3KQ54 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms