Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
A3GALT2U3KPV4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
A3GALT2U3KPV4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
A3GALT2U3KPV4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
A3GALT2U3KPV4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
A3GALT2U3KPV4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
A3GALT2U3KPV4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
A3GALT2U3KPV4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
A3GALT2U3KPV4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
A3GALT2U3KPV4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
A3GALT2U3KPV4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
A3GALT2U3KPV4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
A3GALT2U3KPV4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
A3GALT2U3KPV4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
A3GALT2U3KPV4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
A3GALT2U3KPV4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
A3GALT2U3KPV4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
A3GALT2U3KPV4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
A3GALT2U3KPV4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
A3GALT2U3KPV4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
A3GALT2U3KPV4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
A3GALT2U3KPV4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
A3GALT2U3KPV4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
A3GALT2U3KPV4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
A3GALT2U3KPV4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
A3GALT2U3KPV4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
A3GALT2U3KPV4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
A3GALT2U3KPV4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
A3GALT2U3KPV4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
A3GALT2U3KPV4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
A3GALT2U3KPV4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
A3GALT2U3KPV4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
A3GALT2U3KPV4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
A3GALT2U3KPV4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
A3GALT2U3KPV4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
A3GALT2U3KPV4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
A3GALT2U3KPV4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
A3GALT2U3KPV4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
A3GALT2U3KPV4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
A3GALT2U3KPV4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
A3GALT2U3KPV4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
A3GALT2U3KPV4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
A3GALT2U3KPV4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
A3GALT2U3KPV4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
A3GALT2U3KPV4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
A3GALT2U3KPV4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
A3GALT2U3KPV4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
A3GALT2U3KPV4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
A3GALT2U3KPV4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
A3GALT2U3KPV4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
A3GALT2U3KPV4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
A3GALT2U3KPV4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
A3GALT2U3KPV4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
A3GALT2U3KPV4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
A3GALT2U3KPV4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
A3GALT2U3KPV4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
A3GALT2U3KPV4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
A3GALT2U3KPV4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
A3GALT2U3KPV4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
A3GALT2U3KPV4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
A3GALT2U3KPV4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
A3GALT2U3KPV4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
A3GALT2U3KPV4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
A3GALT2U3KPV4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
A3GALT2U3KPV4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
A3GALT2U3KPV4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
A3GALT2U3KPV4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
A3GALT2U3KPV4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
A3GALT2U3KPV4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
A3GALT2U3KPV4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
A3GALT2U3KPV4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
A3GALT2U3KPV4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
A3GALT2U3KPV4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
A3GALT2U3KPV4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
A3GALT2U3KPV4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
A3GALT2U3KPV4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
A3GALT2U3KPV4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
A3GALT2U3KPV4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
A3GALT2U3KPV4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
A3GALT2U3KPV4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
A3GALT2U3KPV4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
A3GALT2U3KPV4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
A3GALT2U3KPV4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
A3GALT2U3KPV4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
A3GALT2U3KPV4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
A3GALT2U3KPV4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
A3GALT2U3KPV4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
A3GALT2U3KPV4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
A3GALT2U3KPV4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
A3GALT2U3KPV4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
A3GALT2U3KPV4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
A3GALT2U3KPV4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
A3GALT2U3KPV4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
A3GALT2U3KPV4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
A3GALT2U3KPV4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
A3GALT2U3KPV4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
A3GALT2U3KPV4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
A3GALT2U3KPV4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
A3GALT2U3KPV4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
A3GALT2U3KPV4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms