Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UTP11Q9Y3A2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UTP11Q9Y3A2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UTP11Q9Y3A2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UTP11Q9Y3A2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UTP11Q9Y3A2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UTP11Q9Y3A2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UTP11Q9Y3A2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UTP11Q9Y3A2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UTP11Q9Y3A2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UTP11Q9Y3A2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UTP11Q9Y3A2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UTP11Q9Y3A2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UTP11Q9Y3A2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UTP11Q9Y3A2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UTP11Q9Y3A2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UTP11Q9Y3A2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
UTP11Q9Y3A2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UTP11Q9Y3A2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UTP11Q9Y3A2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UTP11Q9Y3A2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UTP11Q9Y3A2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UTP11Q9Y3A2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
UTP11Q9Y3A2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UTP11Q9Y3A2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UTP11Q9Y3A2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UTP11Q9Y3A2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UTP11Q9Y3A2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UTP11Q9Y3A2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UTP11Q9Y3A2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UTP11Q9Y3A2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UTP11Q9Y3A2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UTP11Q9Y3A2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UTP11Q9Y3A2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UTP11Q9Y3A2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UTP11Q9Y3A2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UTP11Q9Y3A2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UTP11Q9Y3A2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UTP11Q9Y3A2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UTP11Q9Y3A2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UTP11Q9Y3A2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UTP11Q9Y3A2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UTP11Q9Y3A2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UTP11Q9Y3A2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UTP11Q9Y3A2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UTP11Q9Y3A2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UTP11Q9Y3A2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UTP11Q9Y3A2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UTP11Q9Y3A2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UTP11Q9Y3A2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
UTP11Q9Y3A2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UTP11Q9Y3A2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UTP11Q9Y3A2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UTP11Q9Y3A2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UTP11Q9Y3A2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UTP11Q9Y3A2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UTP11Q9Y3A2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UTP11Q9Y3A2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UTP11Q9Y3A2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UTP11Q9Y3A2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UTP11Q9Y3A2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UTP11Q9Y3A2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UTP11Q9Y3A2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UTP11Q9Y3A2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UTP11Q9Y3A2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UTP11Q9Y3A2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UTP11Q9Y3A2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
UTP11Q9Y3A2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UTP11Q9Y3A2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UTP11Q9Y3A2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UTP11Q9Y3A2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UTP11Q9Y3A2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UTP11Q9Y3A2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UTP11Q9Y3A2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UTP11Q9Y3A2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UTP11Q9Y3A2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UTP11Q9Y3A2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UTP11Q9Y3A2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UTP11Q9Y3A2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UTP11Q9Y3A2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UTP11Q9Y3A2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UTP11Q9Y3A2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UTP11Q9Y3A2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
UTP11Q9Y3A2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
UTP11Q9Y3A2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UTP11Q9Y3A2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UTP11Q9Y3A2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UTP11Q9Y3A2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UTP11Q9Y3A2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UTP11Q9Y3A2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UTP11Q9Y3A2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UTP11Q9Y3A2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UTP11Q9Y3A2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UTP11Q9Y3A2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UTP11Q9Y3A2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UTP11Q9Y3A2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UTP11Q9Y3A2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UTP11Q9Y3A2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UTP11Q9Y3A2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UTP11Q9Y3A2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms