Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A0

COQ4, Ubiquinone biosynthesis protein COQ4 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COQ4Q9Y3A0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COQ4Q9Y3A0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COQ4Q9Y3A0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COQ4Q9Y3A0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COQ4Q9Y3A0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
COQ4Q9Y3A0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COQ4Q9Y3A0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COQ4Q9Y3A0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COQ4Q9Y3A0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COQ4Q9Y3A0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COQ4Q9Y3A0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COQ4Q9Y3A0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
COQ4Q9Y3A0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COQ4Q9Y3A0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COQ4Q9Y3A0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COQ4Q9Y3A0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COQ4Q9Y3A0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COQ4Q9Y3A0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
COQ4Q9Y3A0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COQ4Q9Y3A0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COQ4Q9Y3A0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
COQ4Q9Y3A0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COQ4Q9Y3A0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COQ4Q9Y3A0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COQ4Q9Y3A0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COQ4Q9Y3A0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COQ4Q9Y3A0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
COQ4Q9Y3A0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COQ4Q9Y3A0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COQ4Q9Y3A0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COQ4Q9Y3A0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COQ4Q9Y3A0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COQ4Q9Y3A0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COQ4Q9Y3A0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COQ4Q9Y3A0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
COQ4Q9Y3A0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COQ4Q9Y3A0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
COQ4Q9Y3A0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COQ4Q9Y3A0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COQ4Q9Y3A0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COQ4Q9Y3A0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COQ4Q9Y3A0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COQ4Q9Y3A0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COQ4Q9Y3A0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COQ4Q9Y3A0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
COQ4Q9Y3A0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
COQ4Q9Y3A0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
COQ4Q9Y3A0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
COQ4Q9Y3A0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
COQ4Q9Y3A0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COQ4Q9Y3A0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COQ4Q9Y3A0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COQ4Q9Y3A0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COQ4Q9Y3A0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COQ4Q9Y3A0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COQ4Q9Y3A0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COQ4Q9Y3A0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COQ4Q9Y3A0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COQ4Q9Y3A0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COQ4Q9Y3A0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COQ4Q9Y3A0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COQ4Q9Y3A0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
COQ4Q9Y3A0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COQ4Q9Y3A0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COQ4Q9Y3A0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COQ4Q9Y3A0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COQ4Q9Y3A0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COQ4Q9Y3A0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
COQ4Q9Y3A0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COQ4Q9Y3A0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COQ4Q9Y3A0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COQ4Q9Y3A0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COQ4Q9Y3A0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COQ4Q9Y3A0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COQ4Q9Y3A0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COQ4Q9Y3A0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COQ4Q9Y3A0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COQ4Q9Y3A0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COQ4Q9Y3A0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COQ4Q9Y3A0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COQ4Q9Y3A0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COQ4Q9Y3A0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COQ4Q9Y3A0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COQ4Q9Y3A0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COQ4Q9Y3A0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COQ4Q9Y3A0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COQ4Q9Y3A0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COQ4Q9Y3A0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
COQ4Q9Y3A0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COQ4Q9Y3A0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COQ4Q9Y3A0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COQ4Q9Y3A0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COQ4Q9Y3A0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COQ4Q9Y3A0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COQ4Q9Y3A0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COQ4Q9Y3A0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COQ4Q9Y3A0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COQ4Q9Y3A0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COQ4Q9Y3A0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COQ4Q9Y3A0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms