Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPNE7Q9UBL6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPNE7Q9UBL6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CPNE7Q9UBL6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPNE7Q9UBL6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPNE7Q9UBL6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPNE7Q9UBL6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPNE7Q9UBL6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPNE7Q9UBL6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPNE7Q9UBL6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPNE7Q9UBL6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPNE7Q9UBL6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPNE7Q9UBL6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPNE7Q9UBL6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPNE7Q9UBL6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPNE7Q9UBL6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPNE7Q9UBL6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPNE7Q9UBL6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPNE7Q9UBL6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPNE7Q9UBL6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPNE7Q9UBL6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPNE7Q9UBL6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPNE7Q9UBL6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPNE7Q9UBL6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPNE7Q9UBL6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPNE7Q9UBL6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPNE7Q9UBL6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPNE7Q9UBL6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPNE7Q9UBL6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPNE7Q9UBL6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPNE7Q9UBL6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPNE7Q9UBL6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPNE7Q9UBL6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPNE7Q9UBL6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPNE7Q9UBL6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPNE7Q9UBL6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPNE7Q9UBL6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPNE7Q9UBL6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPNE7Q9UBL6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPNE7Q9UBL6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPNE7Q9UBL6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPNE7Q9UBL6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPNE7Q9UBL6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPNE7Q9UBL6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPNE7Q9UBL6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPNE7Q9UBL6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPNE7Q9UBL6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPNE7Q9UBL6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CPNE7Q9UBL6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CPNE7Q9UBL6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPNE7Q9UBL6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPNE7Q9UBL6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPNE7Q9UBL6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPNE7Q9UBL6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPNE7Q9UBL6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPNE7Q9UBL6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPNE7Q9UBL6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPNE7Q9UBL6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPNE7Q9UBL6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPNE7Q9UBL6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPNE7Q9UBL6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPNE7Q9UBL6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPNE7Q9UBL6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPNE7Q9UBL6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPNE7Q9UBL6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPNE7Q9UBL6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPNE7Q9UBL6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPNE7Q9UBL6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPNE7Q9UBL6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPNE7Q9UBL6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPNE7Q9UBL6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPNE7Q9UBL6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CPNE7Q9UBL6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPNE7Q9UBL6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPNE7Q9UBL6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPNE7Q9UBL6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPNE7Q9UBL6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPNE7Q9UBL6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPNE7Q9UBL6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPNE7Q9UBL6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPNE7Q9UBL6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPNE7Q9UBL6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPNE7Q9UBL6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPNE7Q9UBL6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPNE7Q9UBL6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPNE7Q9UBL6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPNE7Q9UBL6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPNE7Q9UBL6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPNE7Q9UBL6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPNE7Q9UBL6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPNE7Q9UBL6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPNE7Q9UBL6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPNE7Q9UBL6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPNE7Q9UBL6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPNE7Q9UBL6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPNE7Q9UBL6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPNE7Q9UBL6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CPNE7Q9UBL6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPNE7Q9UBL6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPNE7Q9UBL6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms