Protein–RNA interactions for Protein: Q9P253

VPS18, Vacuolar protein sorting-associated protein 18 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS18Q9P253 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS18Q9P253 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS18Q9P253 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS18Q9P253 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS18Q9P253 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS18Q9P253 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS18Q9P253 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS18Q9P253 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS18Q9P253 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS18Q9P253 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS18Q9P253 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS18Q9P253 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS18Q9P253 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS18Q9P253 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS18Q9P253 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS18Q9P253 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS18Q9P253 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS18Q9P253 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS18Q9P253 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS18Q9P253 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS18Q9P253 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS18Q9P253 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS18Q9P253 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS18Q9P253 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS18Q9P253 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS18Q9P253 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS18Q9P253 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS18Q9P253 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS18Q9P253 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS18Q9P253 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS18Q9P253 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS18Q9P253 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS18Q9P253 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS18Q9P253 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS18Q9P253 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS18Q9P253 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS18Q9P253 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS18Q9P253 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS18Q9P253 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS18Q9P253 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS18Q9P253 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS18Q9P253 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS18Q9P253 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS18Q9P253 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS18Q9P253 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS18Q9P253 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS18Q9P253 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS18Q9P253 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS18Q9P253 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS18Q9P253 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS18Q9P253 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS18Q9P253 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS18Q9P253 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS18Q9P253 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS18Q9P253 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS18Q9P253 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS18Q9P253 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS18Q9P253 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS18Q9P253 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS18Q9P253 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS18Q9P253 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS18Q9P253 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS18Q9P253 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS18Q9P253 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VPS18Q9P253 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VPS18Q9P253 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VPS18Q9P253 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VPS18Q9P253 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VPS18Q9P253 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VPS18Q9P253 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS18Q9P253 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS18Q9P253 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS18Q9P253 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS18Q9P253 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS18Q9P253 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS18Q9P253 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS18Q9P253 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS18Q9P253 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS18Q9P253 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS18Q9P253 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS18Q9P253 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS18Q9P253 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS18Q9P253 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS18Q9P253 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS18Q9P253 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS18Q9P253 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS18Q9P253 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS18Q9P253 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS18Q9P253 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS18Q9P253 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
VPS18Q9P253 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
VPS18Q9P253 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VPS18Q9P253 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VPS18Q9P253 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VPS18Q9P253 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VPS18Q9P253 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS18Q9P253 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS18Q9P253 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS18Q9P253 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS18Q9P253 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms