Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDP1Q9P0J1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDP1Q9P0J1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDP1Q9P0J1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDP1Q9P0J1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDP1Q9P0J1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDP1Q9P0J1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDP1Q9P0J1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDP1Q9P0J1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDP1Q9P0J1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDP1Q9P0J1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDP1Q9P0J1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PDP1Q9P0J1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDP1Q9P0J1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PDP1Q9P0J1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDP1Q9P0J1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDP1Q9P0J1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDP1Q9P0J1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDP1Q9P0J1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDP1Q9P0J1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDP1Q9P0J1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDP1Q9P0J1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDP1Q9P0J1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDP1Q9P0J1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDP1Q9P0J1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDP1Q9P0J1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDP1Q9P0J1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDP1Q9P0J1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDP1Q9P0J1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDP1Q9P0J1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDP1Q9P0J1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDP1Q9P0J1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDP1Q9P0J1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDP1Q9P0J1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDP1Q9P0J1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDP1Q9P0J1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDP1Q9P0J1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDP1Q9P0J1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDP1Q9P0J1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PDP1Q9P0J1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDP1Q9P0J1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDP1Q9P0J1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDP1Q9P0J1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDP1Q9P0J1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDP1Q9P0J1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDP1Q9P0J1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDP1Q9P0J1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDP1Q9P0J1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDP1Q9P0J1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDP1Q9P0J1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PDP1Q9P0J1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDP1Q9P0J1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDP1Q9P0J1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDP1Q9P0J1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDP1Q9P0J1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDP1Q9P0J1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDP1Q9P0J1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDP1Q9P0J1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PDP1Q9P0J1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDP1Q9P0J1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDP1Q9P0J1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDP1Q9P0J1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDP1Q9P0J1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDP1Q9P0J1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDP1Q9P0J1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDP1Q9P0J1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDP1Q9P0J1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDP1Q9P0J1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDP1Q9P0J1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PDP1Q9P0J1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDP1Q9P0J1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDP1Q9P0J1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDP1Q9P0J1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDP1Q9P0J1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDP1Q9P0J1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDP1Q9P0J1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDP1Q9P0J1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDP1Q9P0J1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDP1Q9P0J1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PDP1Q9P0J1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDP1Q9P0J1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDP1Q9P0J1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDP1Q9P0J1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDP1Q9P0J1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDP1Q9P0J1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDP1Q9P0J1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDP1Q9P0J1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDP1Q9P0J1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDP1Q9P0J1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDP1Q9P0J1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDP1Q9P0J1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDP1Q9P0J1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDP1Q9P0J1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PDP1Q9P0J1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDP1Q9P0J1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDP1Q9P0J1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDP1Q9P0J1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDP1Q9P0J1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDP1Q9P0J1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDP1Q9P0J1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.7 ms