Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ0

DNAJC27, DnaJ homolog subfamily C member 27, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC27Q9NZQ0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DNAJC27Q9NZQ0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DNAJC27Q9NZQ0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DNAJC27Q9NZQ0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
DNAJC27Q9NZQ0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DNAJC27Q9NZQ0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DNAJC27Q9NZQ0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DNAJC27Q9NZQ0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DNAJC27Q9NZQ0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DNAJC27Q9NZQ0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DNAJC27Q9NZQ0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DNAJC27Q9NZQ0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DNAJC27Q9NZQ0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DNAJC27Q9NZQ0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DNAJC27Q9NZQ0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DNAJC27Q9NZQ0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DNAJC27Q9NZQ0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DNAJC27Q9NZQ0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DNAJC27Q9NZQ0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DNAJC27Q9NZQ0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DNAJC27Q9NZQ0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DNAJC27Q9NZQ0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DNAJC27Q9NZQ0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DNAJC27Q9NZQ0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DNAJC27Q9NZQ0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DNAJC27Q9NZQ0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DNAJC27Q9NZQ0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DNAJC27Q9NZQ0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DNAJC27Q9NZQ0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DNAJC27Q9NZQ0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DNAJC27Q9NZQ0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DNAJC27Q9NZQ0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DNAJC27Q9NZQ0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DNAJC27Q9NZQ0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DNAJC27Q9NZQ0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DNAJC27Q9NZQ0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DNAJC27Q9NZQ0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DNAJC27Q9NZQ0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DNAJC27Q9NZQ0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DNAJC27Q9NZQ0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DNAJC27Q9NZQ0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DNAJC27Q9NZQ0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
DNAJC27Q9NZQ0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DNAJC27Q9NZQ0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DNAJC27Q9NZQ0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DNAJC27Q9NZQ0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DNAJC27Q9NZQ0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DNAJC27Q9NZQ0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DNAJC27Q9NZQ0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DNAJC27Q9NZQ0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DNAJC27Q9NZQ0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DNAJC27Q9NZQ0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
DNAJC27Q9NZQ0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DNAJC27Q9NZQ0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DNAJC27Q9NZQ0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DNAJC27Q9NZQ0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DNAJC27Q9NZQ0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DNAJC27Q9NZQ0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DNAJC27Q9NZQ0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DNAJC27Q9NZQ0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DNAJC27Q9NZQ0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DNAJC27Q9NZQ0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DNAJC27Q9NZQ0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DNAJC27Q9NZQ0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DNAJC27Q9NZQ0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DNAJC27Q9NZQ0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DNAJC27Q9NZQ0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DNAJC27Q9NZQ0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DNAJC27Q9NZQ0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DNAJC27Q9NZQ0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DNAJC27Q9NZQ0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DNAJC27Q9NZQ0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DNAJC27Q9NZQ0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DNAJC27Q9NZQ0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DNAJC27Q9NZQ0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DNAJC27Q9NZQ0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DNAJC27Q9NZQ0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DNAJC27Q9NZQ0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DNAJC27Q9NZQ0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAJC27Q9NZQ0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAJC27Q9NZQ0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAJC27Q9NZQ0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAJC27Q9NZQ0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAJC27Q9NZQ0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAJC27Q9NZQ0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAJC27Q9NZQ0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAJC27Q9NZQ0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAJC27Q9NZQ0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAJC27Q9NZQ0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAJC27Q9NZQ0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAJC27Q9NZQ0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAJC27Q9NZQ0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAJC27Q9NZQ0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAJC27Q9NZQ0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAJC27Q9NZQ0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAJC27Q9NZQ0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAJC27Q9NZQ0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DNAJC27Q9NZQ0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DNAJC27Q9NZQ0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DNAJC27Q9NZQ0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.6 ms