Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNA2D2Q9NY47 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNA2D2Q9NY47 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNA2D2Q9NY47 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNA2D2Q9NY47 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNA2D2Q9NY47 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNA2D2Q9NY47 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA2D2Q9NY47 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA2D2Q9NY47 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA2D2Q9NY47 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA2D2Q9NY47 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA2D2Q9NY47 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA2D2Q9NY47 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA2D2Q9NY47 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNA2D2Q9NY47 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNA2D2Q9NY47 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNA2D2Q9NY47 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNA2D2Q9NY47 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNA2D2Q9NY47 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA2D2Q9NY47 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA2D2Q9NY47 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA2D2Q9NY47 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA2D2Q9NY47 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA2D2Q9NY47 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA2D2Q9NY47 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA2D2Q9NY47 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA2D2Q9NY47 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA2D2Q9NY47 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA2D2Q9NY47 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA2D2Q9NY47 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA2D2Q9NY47 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA2D2Q9NY47 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA2D2Q9NY47 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA2D2Q9NY47 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA2D2Q9NY47 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA2D2Q9NY47 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA2D2Q9NY47 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA2D2Q9NY47 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA2D2Q9NY47 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNA2D2Q9NY47 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNA2D2Q9NY47 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNA2D2Q9NY47 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNA2D2Q9NY47 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNA2D2Q9NY47 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA2D2Q9NY47 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA2D2Q9NY47 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA2D2Q9NY47 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA2D2Q9NY47 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA2D2Q9NY47 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA2D2Q9NY47 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA2D2Q9NY47 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA2D2Q9NY47 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA2D2Q9NY47 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA2D2Q9NY47 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA2D2Q9NY47 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA2D2Q9NY47 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA2D2Q9NY47 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA2D2Q9NY47 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA2D2Q9NY47 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CACNA2D2Q9NY47 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CACNA2D2Q9NY47 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CACNA2D2Q9NY47 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA2D2Q9NY47 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms