Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4E7

DEF6, Differentially expressed in FDCP 6 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEF6Q9H4E7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DEF6Q9H4E7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DEF6Q9H4E7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DEF6Q9H4E7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DEF6Q9H4E7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DEF6Q9H4E7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
DEF6Q9H4E7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
DEF6Q9H4E7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
DEF6Q9H4E7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DEF6Q9H4E7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DEF6Q9H4E7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DEF6Q9H4E7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DEF6Q9H4E7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
DEF6Q9H4E7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DEF6Q9H4E7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DEF6Q9H4E7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DEF6Q9H4E7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DEF6Q9H4E7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DEF6Q9H4E7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DEF6Q9H4E7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DEF6Q9H4E7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DEF6Q9H4E7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DEF6Q9H4E7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DEF6Q9H4E7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DEF6Q9H4E7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DEF6Q9H4E7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DEF6Q9H4E7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DEF6Q9H4E7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DEF6Q9H4E7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DEF6Q9H4E7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DEF6Q9H4E7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DEF6Q9H4E7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DEF6Q9H4E7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DEF6Q9H4E7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DEF6Q9H4E7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DEF6Q9H4E7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DEF6Q9H4E7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DEF6Q9H4E7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DEF6Q9H4E7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DEF6Q9H4E7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DEF6Q9H4E7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DEF6Q9H4E7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DEF6Q9H4E7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DEF6Q9H4E7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DEF6Q9H4E7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DEF6Q9H4E7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DEF6Q9H4E7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DEF6Q9H4E7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DEF6Q9H4E7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DEF6Q9H4E7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DEF6Q9H4E7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DEF6Q9H4E7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DEF6Q9H4E7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DEF6Q9H4E7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DEF6Q9H4E7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DEF6Q9H4E7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DEF6Q9H4E7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
DEF6Q9H4E7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DEF6Q9H4E7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DEF6Q9H4E7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DEF6Q9H4E7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DEF6Q9H4E7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DEF6Q9H4E7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DEF6Q9H4E7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DEF6Q9H4E7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DEF6Q9H4E7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
DEF6Q9H4E7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
DEF6Q9H4E7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DEF6Q9H4E7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DEF6Q9H4E7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DEF6Q9H4E7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DEF6Q9H4E7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DEF6Q9H4E7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DEF6Q9H4E7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DEF6Q9H4E7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DEF6Q9H4E7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DEF6Q9H4E7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DEF6Q9H4E7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DEF6Q9H4E7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DEF6Q9H4E7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
DEF6Q9H4E7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DEF6Q9H4E7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DEF6Q9H4E7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DEF6Q9H4E7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DEF6Q9H4E7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DEF6Q9H4E7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DEF6Q9H4E7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DEF6Q9H4E7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DEF6Q9H4E7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DEF6Q9H4E7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
DEF6Q9H4E7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DEF6Q9H4E7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DEF6Q9H4E7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DEF6Q9H4E7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DEF6Q9H4E7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DEF6Q9H4E7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DEF6Q9H4E7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DEF6Q9H4E7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DEF6Q9H4E7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DEF6Q9H4E7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms