Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GFRA4Q9GZZ7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GFRA4Q9GZZ7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GFRA4Q9GZZ7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GFRA4Q9GZZ7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GFRA4Q9GZZ7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GFRA4Q9GZZ7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GFRA4Q9GZZ7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GFRA4Q9GZZ7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GFRA4Q9GZZ7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GFRA4Q9GZZ7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GFRA4Q9GZZ7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GFRA4Q9GZZ7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GFRA4Q9GZZ7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GFRA4Q9GZZ7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GFRA4Q9GZZ7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms