Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ2

SHCBP1L, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHCBP1LQ9BZQ2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHCBP1LQ9BZQ2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHCBP1LQ9BZQ2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHCBP1LQ9BZQ2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHCBP1LQ9BZQ2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHCBP1LQ9BZQ2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHCBP1LQ9BZQ2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SHCBP1LQ9BZQ2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHCBP1LQ9BZQ2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHCBP1LQ9BZQ2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SHCBP1LQ9BZQ2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHCBP1LQ9BZQ2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHCBP1LQ9BZQ2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHCBP1LQ9BZQ2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHCBP1LQ9BZQ2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHCBP1LQ9BZQ2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHCBP1LQ9BZQ2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHCBP1LQ9BZQ2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHCBP1LQ9BZQ2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHCBP1LQ9BZQ2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHCBP1LQ9BZQ2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHCBP1LQ9BZQ2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SHCBP1LQ9BZQ2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHCBP1LQ9BZQ2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHCBP1LQ9BZQ2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHCBP1LQ9BZQ2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHCBP1LQ9BZQ2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHCBP1LQ9BZQ2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHCBP1LQ9BZQ2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHCBP1LQ9BZQ2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SHCBP1LQ9BZQ2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHCBP1LQ9BZQ2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHCBP1LQ9BZQ2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHCBP1LQ9BZQ2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHCBP1LQ9BZQ2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHCBP1LQ9BZQ2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHCBP1LQ9BZQ2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHCBP1LQ9BZQ2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHCBP1LQ9BZQ2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHCBP1LQ9BZQ2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHCBP1LQ9BZQ2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHCBP1LQ9BZQ2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHCBP1LQ9BZQ2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SHCBP1LQ9BZQ2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHCBP1LQ9BZQ2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHCBP1LQ9BZQ2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHCBP1LQ9BZQ2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHCBP1LQ9BZQ2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHCBP1LQ9BZQ2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHCBP1LQ9BZQ2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHCBP1LQ9BZQ2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHCBP1LQ9BZQ2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHCBP1LQ9BZQ2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHCBP1LQ9BZQ2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHCBP1LQ9BZQ2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHCBP1LQ9BZQ2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHCBP1LQ9BZQ2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SHCBP1LQ9BZQ2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHCBP1LQ9BZQ2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHCBP1LQ9BZQ2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHCBP1LQ9BZQ2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SHCBP1LQ9BZQ2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHCBP1LQ9BZQ2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHCBP1LQ9BZQ2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHCBP1LQ9BZQ2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHCBP1LQ9BZQ2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHCBP1LQ9BZQ2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHCBP1LQ9BZQ2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHCBP1LQ9BZQ2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHCBP1LQ9BZQ2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHCBP1LQ9BZQ2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHCBP1LQ9BZQ2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHCBP1LQ9BZQ2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHCBP1LQ9BZQ2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SHCBP1LQ9BZQ2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHCBP1LQ9BZQ2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHCBP1LQ9BZQ2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHCBP1LQ9BZQ2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHCBP1LQ9BZQ2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHCBP1LQ9BZQ2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHCBP1LQ9BZQ2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHCBP1LQ9BZQ2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHCBP1LQ9BZQ2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHCBP1LQ9BZQ2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHCBP1LQ9BZQ2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHCBP1LQ9BZQ2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHCBP1LQ9BZQ2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHCBP1LQ9BZQ2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHCBP1LQ9BZQ2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHCBP1LQ9BZQ2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHCBP1LQ9BZQ2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHCBP1LQ9BZQ2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHCBP1LQ9BZQ2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHCBP1LQ9BZQ2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHCBP1LQ9BZQ2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHCBP1LQ9BZQ2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHCBP1LQ9BZQ2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHCBP1LQ9BZQ2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHCBP1LQ9BZQ2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SHCBP1LQ9BZQ2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms