Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW27

NUP85, Nuclear pore complex protein Nup85, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP85Q9BW27 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP85Q9BW27 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP85Q9BW27 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP85Q9BW27 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP85Q9BW27 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP85Q9BW27 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP85Q9BW27 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP85Q9BW27 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP85Q9BW27 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP85Q9BW27 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP85Q9BW27 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP85Q9BW27 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP85Q9BW27 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP85Q9BW27 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP85Q9BW27 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUP85Q9BW27 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NUP85Q9BW27 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NUP85Q9BW27 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NUP85Q9BW27 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NUP85Q9BW27 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP85Q9BW27 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP85Q9BW27 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP85Q9BW27 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP85Q9BW27 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP85Q9BW27 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP85Q9BW27 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP85Q9BW27 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUP85Q9BW27 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUP85Q9BW27 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NUP85Q9BW27 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUP85Q9BW27 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUP85Q9BW27 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP85Q9BW27 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP85Q9BW27 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP85Q9BW27 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP85Q9BW27 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP85Q9BW27 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP85Q9BW27 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP85Q9BW27 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP85Q9BW27 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP85Q9BW27 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP85Q9BW27 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP85Q9BW27 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUP85Q9BW27 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUP85Q9BW27 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUP85Q9BW27 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUP85Q9BW27 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP85Q9BW27 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP85Q9BW27 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP85Q9BW27 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP85Q9BW27 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP85Q9BW27 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP85Q9BW27 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP85Q9BW27 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUP85Q9BW27 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUP85Q9BW27 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUP85Q9BW27 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUP85Q9BW27 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUP85Q9BW27 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUP85Q9BW27 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUP85Q9BW27 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUP85Q9BW27 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUP85Q9BW27 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NUP85Q9BW27 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NUP85Q9BW27 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUP85Q9BW27 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NUP85Q9BW27 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUP85Q9BW27 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUP85Q9BW27 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NUP85Q9BW27 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUP85Q9BW27 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUP85Q9BW27 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUP85Q9BW27 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP85Q9BW27 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP85Q9BW27 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP85Q9BW27 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP85Q9BW27 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP85Q9BW27 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP85Q9BW27 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP85Q9BW27 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP85Q9BW27 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP85Q9BW27 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP85Q9BW27 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP85Q9BW27 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP85Q9BW27 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP85Q9BW27 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP85Q9BW27 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP85Q9BW27 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP85Q9BW27 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP85Q9BW27 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP85Q9BW27 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP85Q9BW27 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP85Q9BW27 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP85Q9BW27 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP85Q9BW27 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP85Q9BW27 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP85Q9BW27 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP85Q9BW27 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP85Q9BW27 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP85Q9BW27 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms