Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RSG1Q9BU20 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RSG1Q9BU20 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RSG1Q9BU20 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RSG1Q9BU20 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
RSG1Q9BU20 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RSG1Q9BU20 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RSG1Q9BU20 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RSG1Q9BU20 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RSG1Q9BU20 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RSG1Q9BU20 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RSG1Q9BU20 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RSG1Q9BU20 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RSG1Q9BU20 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RSG1Q9BU20 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RSG1Q9BU20 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RSG1Q9BU20 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RSG1Q9BU20 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RSG1Q9BU20 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RSG1Q9BU20 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RSG1Q9BU20 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RSG1Q9BU20 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RSG1Q9BU20 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RSG1Q9BU20 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RSG1Q9BU20 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RSG1Q9BU20 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RSG1Q9BU20 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RSG1Q9BU20 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RSG1Q9BU20 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RSG1Q9BU20 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RSG1Q9BU20 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RSG1Q9BU20 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RSG1Q9BU20 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RSG1Q9BU20 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RSG1Q9BU20 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RSG1Q9BU20 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RSG1Q9BU20 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RSG1Q9BU20 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RSG1Q9BU20 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RSG1Q9BU20 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RSG1Q9BU20 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RSG1Q9BU20 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RSG1Q9BU20 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RSG1Q9BU20 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RSG1Q9BU20 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RSG1Q9BU20 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RSG1Q9BU20 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RSG1Q9BU20 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RSG1Q9BU20 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RSG1Q9BU20 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RSG1Q9BU20 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RSG1Q9BU20 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms