Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRZ2

TRIM56, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM56, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM56Q9BRZ2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM56Q9BRZ2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM56Q9BRZ2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM56Q9BRZ2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM56Q9BRZ2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM56Q9BRZ2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM56Q9BRZ2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM56Q9BRZ2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM56Q9BRZ2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM56Q9BRZ2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM56Q9BRZ2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM56Q9BRZ2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM56Q9BRZ2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM56Q9BRZ2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM56Q9BRZ2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM56Q9BRZ2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM56Q9BRZ2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM56Q9BRZ2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM56Q9BRZ2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM56Q9BRZ2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM56Q9BRZ2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM56Q9BRZ2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM56Q9BRZ2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM56Q9BRZ2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM56Q9BRZ2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM56Q9BRZ2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM56Q9BRZ2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM56Q9BRZ2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM56Q9BRZ2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM56Q9BRZ2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM56Q9BRZ2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM56Q9BRZ2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM56Q9BRZ2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM56Q9BRZ2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM56Q9BRZ2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM56Q9BRZ2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM56Q9BRZ2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM56Q9BRZ2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM56Q9BRZ2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM56Q9BRZ2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM56Q9BRZ2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM56Q9BRZ2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM56Q9BRZ2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM56Q9BRZ2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM56Q9BRZ2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM56Q9BRZ2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM56Q9BRZ2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM56Q9BRZ2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM56Q9BRZ2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM56Q9BRZ2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM56Q9BRZ2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM56Q9BRZ2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM56Q9BRZ2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM56Q9BRZ2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM56Q9BRZ2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM56Q9BRZ2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM56Q9BRZ2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM56Q9BRZ2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM56Q9BRZ2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM56Q9BRZ2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM56Q9BRZ2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM56Q9BRZ2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM56Q9BRZ2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM56Q9BRZ2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM56Q9BRZ2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM56Q9BRZ2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM56Q9BRZ2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM56Q9BRZ2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM56Q9BRZ2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM56Q9BRZ2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM56Q9BRZ2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM56Q9BRZ2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM56Q9BRZ2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM56Q9BRZ2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM56Q9BRZ2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM56Q9BRZ2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM56Q9BRZ2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM56Q9BRZ2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM56Q9BRZ2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM56Q9BRZ2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM56Q9BRZ2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM56Q9BRZ2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM56Q9BRZ2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM56Q9BRZ2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM56Q9BRZ2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM56Q9BRZ2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM56Q9BRZ2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM56Q9BRZ2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM56Q9BRZ2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM56Q9BRZ2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM56Q9BRZ2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM56Q9BRZ2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM56Q9BRZ2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM56Q9BRZ2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM56Q9BRZ2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM56Q9BRZ2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM56Q9BRZ2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM56Q9BRZ2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM56Q9BRZ2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM56Q9BRZ2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms