Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CITED2Q99967 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CITED2Q99967 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CITED2Q99967 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CITED2Q99967 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CITED2Q99967 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CITED2Q99967 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CITED2Q99967 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CITED2Q99967 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CITED2Q99967 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CITED2Q99967 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CITED2Q99967 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CITED2Q99967 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CITED2Q99967 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CITED2Q99967 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CITED2Q99967 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CITED2Q99967 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CITED2Q99967 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CITED2Q99967 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CITED2Q99967 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CITED2Q99967 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CITED2Q99967 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CITED2Q99967 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CITED2Q99967 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CITED2Q99967 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CITED2Q99967 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CITED2Q99967 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CITED2Q99967 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CITED2Q99967 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CITED2Q99967 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CITED2Q99967 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CITED2Q99967 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CITED2Q99967 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CITED2Q99967 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CITED2Q99967 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CITED2Q99967 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CITED2Q99967 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CITED2Q99967 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CITED2Q99967 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CITED2Q99967 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CITED2Q99967 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CITED2Q99967 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CITED2Q99967 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CITED2Q99967 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CITED2Q99967 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CITED2Q99967 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CITED2Q99967 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CITED2Q99967 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CITED2Q99967 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CITED2Q99967 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CITED2Q99967 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CITED2Q99967 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CITED2Q99967 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CITED2Q99967 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CITED2Q99967 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CITED2Q99967 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CITED2Q99967 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CITED2Q99967 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CITED2Q99967 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CITED2Q99967 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CITED2Q99967 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CITED2Q99967 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CITED2Q99967 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CITED2Q99967 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CITED2Q99967 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CITED2Q99967 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CITED2Q99967 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CITED2Q99967 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CITED2Q99967 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CITED2Q99967 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CITED2Q99967 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CITED2Q99967 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CITED2Q99967 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CITED2Q99967 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CITED2Q99967 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CITED2Q99967 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CITED2Q99967 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CITED2Q99967 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CITED2Q99967 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CITED2Q99967 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CITED2Q99967 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CITED2Q99967 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CITED2Q99967 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CITED2Q99967 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CITED2Q99967 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CITED2Q99967 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CITED2Q99967 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CITED2Q99967 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CITED2Q99967 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CITED2Q99967 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CITED2Q99967 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CITED2Q99967 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CITED2Q99967 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CITED2Q99967 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CITED2Q99967 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CITED2Q99967 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CITED2Q99967 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CITED2Q99967 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CITED2Q99967 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CITED2Q99967 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms