Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HHIPQ96QV1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HHIPQ96QV1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HHIPQ96QV1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HHIPQ96QV1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HHIPQ96QV1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HHIPQ96QV1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HHIPQ96QV1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HHIPQ96QV1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HHIPQ96QV1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HHIPQ96QV1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HHIPQ96QV1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HHIPQ96QV1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HHIPQ96QV1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HHIPQ96QV1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HHIPQ96QV1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HHIPQ96QV1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HHIPQ96QV1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HHIPQ96QV1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HHIPQ96QV1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HHIPQ96QV1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HHIPQ96QV1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HHIPQ96QV1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HHIPQ96QV1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HHIPQ96QV1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HHIPQ96QV1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HHIPQ96QV1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HHIPQ96QV1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HHIPQ96QV1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HHIPQ96QV1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HHIPQ96QV1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HHIPQ96QV1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HHIPQ96QV1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HHIPQ96QV1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HHIPQ96QV1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HHIPQ96QV1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HHIPQ96QV1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HHIPQ96QV1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HHIPQ96QV1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HHIPQ96QV1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HHIPQ96QV1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HHIPQ96QV1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HHIPQ96QV1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HHIPQ96QV1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HHIPQ96QV1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HHIPQ96QV1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HHIPQ96QV1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HHIPQ96QV1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HHIPQ96QV1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HHIPQ96QV1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HHIPQ96QV1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HHIPQ96QV1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HHIPQ96QV1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HHIPQ96QV1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HHIPQ96QV1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HHIPQ96QV1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HHIPQ96QV1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HHIPQ96QV1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HHIPQ96QV1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HHIPQ96QV1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HHIPQ96QV1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HHIPQ96QV1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HHIPQ96QV1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HHIPQ96QV1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HHIPQ96QV1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HHIPQ96QV1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HHIPQ96QV1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HHIPQ96QV1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HHIPQ96QV1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HHIPQ96QV1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HHIPQ96QV1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HHIPQ96QV1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HHIPQ96QV1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HHIPQ96QV1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HHIPQ96QV1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HHIPQ96QV1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HHIPQ96QV1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HHIPQ96QV1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HHIPQ96QV1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HHIPQ96QV1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HHIPQ96QV1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HHIPQ96QV1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HHIPQ96QV1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HHIPQ96QV1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HHIPQ96QV1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HHIPQ96QV1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HHIPQ96QV1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HHIPQ96QV1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HHIPQ96QV1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HHIPQ96QV1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HHIPQ96QV1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HHIPQ96QV1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HHIPQ96QV1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HHIPQ96QV1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HHIPQ96QV1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HHIPQ96QV1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HHIPQ96QV1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HHIPQ96QV1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HHIPQ96QV1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HHIPQ96QV1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms