Protein–RNA interactions for Protein: Q96MV1

TMEM56, Transmembrane protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM56Q96MV1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM56Q96MV1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM56Q96MV1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM56Q96MV1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM56Q96MV1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM56Q96MV1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM56Q96MV1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM56Q96MV1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM56Q96MV1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM56Q96MV1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM56Q96MV1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM56Q96MV1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM56Q96MV1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM56Q96MV1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM56Q96MV1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TMEM56Q96MV1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TMEM56Q96MV1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TMEM56Q96MV1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TMEM56Q96MV1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM56Q96MV1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM56Q96MV1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM56Q96MV1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM56Q96MV1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM56Q96MV1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM56Q96MV1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM56Q96MV1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM56Q96MV1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM56Q96MV1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM56Q96MV1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM56Q96MV1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM56Q96MV1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM56Q96MV1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM56Q96MV1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM56Q96MV1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM56Q96MV1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM56Q96MV1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM56Q96MV1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM56Q96MV1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM56Q96MV1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM56Q96MV1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM56Q96MV1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM56Q96MV1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM56Q96MV1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM56Q96MV1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM56Q96MV1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM56Q96MV1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM56Q96MV1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM56Q96MV1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM56Q96MV1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM56Q96MV1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM56Q96MV1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM56Q96MV1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM56Q96MV1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM56Q96MV1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM56Q96MV1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM56Q96MV1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM56Q96MV1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM56Q96MV1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM56Q96MV1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM56Q96MV1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM56Q96MV1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM56Q96MV1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM56Q96MV1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM56Q96MV1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM56Q96MV1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM56Q96MV1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM56Q96MV1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM56Q96MV1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM56Q96MV1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM56Q96MV1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM56Q96MV1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM56Q96MV1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM56Q96MV1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMEM56Q96MV1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMEM56Q96MV1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMEM56Q96MV1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM56Q96MV1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM56Q96MV1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM56Q96MV1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM56Q96MV1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM56Q96MV1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM56Q96MV1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM56Q96MV1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM56Q96MV1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM56Q96MV1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM56Q96MV1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM56Q96MV1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM56Q96MV1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM56Q96MV1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM56Q96MV1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM56Q96MV1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM56Q96MV1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM56Q96MV1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM56Q96MV1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM56Q96MV1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM56Q96MV1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM56Q96MV1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM56Q96MV1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM56Q96MV1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM56Q96MV1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms