Protein–RNA interactions for Protein: Q96LM1

LINC00615, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00615, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00615Q96LM1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00615Q96LM1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00615Q96LM1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00615Q96LM1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00615Q96LM1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00615Q96LM1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00615Q96LM1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00615Q96LM1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00615Q96LM1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00615Q96LM1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00615Q96LM1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00615Q96LM1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00615Q96LM1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LINC00615Q96LM1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00615Q96LM1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00615Q96LM1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00615Q96LM1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00615Q96LM1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00615Q96LM1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00615Q96LM1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00615Q96LM1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00615Q96LM1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00615Q96LM1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00615Q96LM1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00615Q96LM1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00615Q96LM1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00615Q96LM1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00615Q96LM1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00615Q96LM1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00615Q96LM1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00615Q96LM1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00615Q96LM1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00615Q96LM1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00615Q96LM1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00615Q96LM1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00615Q96LM1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00615Q96LM1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00615Q96LM1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00615Q96LM1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC00615Q96LM1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC00615Q96LM1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC00615Q96LM1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC00615Q96LM1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC00615Q96LM1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC00615Q96LM1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC00615Q96LM1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00615Q96LM1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00615Q96LM1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00615Q96LM1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00615Q96LM1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00615Q96LM1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00615Q96LM1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00615Q96LM1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00615Q96LM1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00615Q96LM1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00615Q96LM1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00615Q96LM1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00615Q96LM1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00615Q96LM1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00615Q96LM1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00615Q96LM1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00615Q96LM1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00615Q96LM1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00615Q96LM1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00615Q96LM1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00615Q96LM1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LINC00615Q96LM1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00615Q96LM1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00615Q96LM1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00615Q96LM1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00615Q96LM1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00615Q96LM1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00615Q96LM1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00615Q96LM1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00615Q96LM1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00615Q96LM1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00615Q96LM1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00615Q96LM1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00615Q96LM1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00615Q96LM1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00615Q96LM1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00615Q96LM1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00615Q96LM1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00615Q96LM1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00615Q96LM1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00615Q96LM1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00615Q96LM1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00615Q96LM1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00615Q96LM1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00615Q96LM1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00615Q96LM1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00615Q96LM1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00615Q96LM1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00615Q96LM1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00615Q96LM1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00615Q96LM1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00615Q96LM1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00615Q96LM1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00615Q96LM1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00615Q96LM1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms